Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHA2

SS18L2, SS18-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18L2Q9UHA2 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SS18L2Q9UHA2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SS18L2Q9UHA2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SS18L2Q9UHA2 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SS18L2Q9UHA2 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SS18L2Q9UHA2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SS18L2Q9UHA2 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SS18L2Q9UHA2 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SS18L2Q9UHA2 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SS18L2Q9UHA2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
SS18L2Q9UHA2 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SS18L2Q9UHA2 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SS18L2Q9UHA2 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SS18L2Q9UHA2 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SS18L2Q9UHA2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SS18L2Q9UHA2 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SS18L2Q9UHA2 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SS18L2Q9UHA2 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SS18L2Q9UHA2 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SS18L2Q9UHA2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SS18L2Q9UHA2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SS18L2Q9UHA2 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SS18L2Q9UHA2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SS18L2Q9UHA2 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SS18L2Q9UHA2 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SS18L2Q9UHA2 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SS18L2Q9UHA2 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SS18L2Q9UHA2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SS18L2Q9UHA2 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SS18L2Q9UHA2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SS18L2Q9UHA2 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SS18L2Q9UHA2 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SS18L2Q9UHA2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SS18L2Q9UHA2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SS18L2Q9UHA2 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SS18L2Q9UHA2 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SS18L2Q9UHA2 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SS18L2Q9UHA2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SS18L2Q9UHA2 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SS18L2Q9UHA2 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SS18L2Q9UHA2 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SS18L2Q9UHA2 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SS18L2Q9UHA2 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SS18L2Q9UHA2 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SS18L2Q9UHA2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SS18L2Q9UHA2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SS18L2Q9UHA2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SS18L2Q9UHA2 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SS18L2Q9UHA2 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SS18L2Q9UHA2 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SS18L2Q9UHA2 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SS18L2Q9UHA2 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SS18L2Q9UHA2 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SS18L2Q9UHA2 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SS18L2Q9UHA2 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SS18L2Q9UHA2 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
SS18L2Q9UHA2 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SS18L2Q9UHA2 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SS18L2Q9UHA2 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SS18L2Q9UHA2 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SS18L2Q9UHA2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SS18L2Q9UHA2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SS18L2Q9UHA2 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SS18L2Q9UHA2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SS18L2Q9UHA2 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SS18L2Q9UHA2 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SS18L2Q9UHA2 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SS18L2Q9UHA2 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SS18L2Q9UHA2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SS18L2Q9UHA2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SS18L2Q9UHA2 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SS18L2Q9UHA2 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SS18L2Q9UHA2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SS18L2Q9UHA2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SS18L2Q9UHA2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SS18L2Q9UHA2 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SS18L2Q9UHA2 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SS18L2Q9UHA2 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SS18L2Q9UHA2 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SS18L2Q9UHA2 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SS18L2Q9UHA2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SS18L2Q9UHA2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SS18L2Q9UHA2 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SS18L2Q9UHA2 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SS18L2Q9UHA2 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SS18L2Q9UHA2 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SS18L2Q9UHA2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SS18L2Q9UHA2 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SS18L2Q9UHA2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SS18L2Q9UHA2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SS18L2Q9UHA2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
SS18L2Q9UHA2 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SS18L2Q9UHA2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SS18L2Q9UHA2 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SS18L2Q9UHA2 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SS18L2Q9UHA2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SS18L2Q9UHA2 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SS18L2Q9UHA2 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SS18L2Q9UHA2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SS18L2Q9UHA2 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms