Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGJ1

TUBGCP4, Gamma-tubulin complex component 4, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP4Q9UGJ1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TUBGCP4Q9UGJ1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TUBGCP4Q9UGJ1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TUBGCP4Q9UGJ1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TUBGCP4Q9UGJ1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TUBGCP4Q9UGJ1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TUBGCP4Q9UGJ1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TUBGCP4Q9UGJ1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TUBGCP4Q9UGJ1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBGCP4Q9UGJ1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBGCP4Q9UGJ1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBGCP4Q9UGJ1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBGCP4Q9UGJ1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBGCP4Q9UGJ1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBGCP4Q9UGJ1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBGCP4Q9UGJ1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBGCP4Q9UGJ1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBGCP4Q9UGJ1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBGCP4Q9UGJ1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBGCP4Q9UGJ1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TUBGCP4Q9UGJ1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TUBGCP4Q9UGJ1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TUBGCP4Q9UGJ1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TUBGCP4Q9UGJ1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TUBGCP4Q9UGJ1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TUBGCP4Q9UGJ1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TUBGCP4Q9UGJ1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TUBGCP4Q9UGJ1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TUBGCP4Q9UGJ1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TUBGCP4Q9UGJ1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TUBGCP4Q9UGJ1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TUBGCP4Q9UGJ1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TUBGCP4Q9UGJ1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TUBGCP4Q9UGJ1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TUBGCP4Q9UGJ1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TUBGCP4Q9UGJ1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TUBGCP4Q9UGJ1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TUBGCP4Q9UGJ1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TUBGCP4Q9UGJ1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBGCP4Q9UGJ1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBGCP4Q9UGJ1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBGCP4Q9UGJ1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBGCP4Q9UGJ1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBGCP4Q9UGJ1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBGCP4Q9UGJ1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBGCP4Q9UGJ1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBGCP4Q9UGJ1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBGCP4Q9UGJ1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBGCP4Q9UGJ1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBGCP4Q9UGJ1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBGCP4Q9UGJ1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBGCP4Q9UGJ1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBGCP4Q9UGJ1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBGCP4Q9UGJ1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBGCP4Q9UGJ1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBGCP4Q9UGJ1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBGCP4Q9UGJ1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TUBGCP4Q9UGJ1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TUBGCP4Q9UGJ1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TUBGCP4Q9UGJ1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TUBGCP4Q9UGJ1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TUBGCP4Q9UGJ1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TUBGCP4Q9UGJ1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TUBGCP4Q9UGJ1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TUBGCP4Q9UGJ1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TUBGCP4Q9UGJ1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TUBGCP4Q9UGJ1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TUBGCP4Q9UGJ1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TUBGCP4Q9UGJ1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TUBGCP4Q9UGJ1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TUBGCP4Q9UGJ1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TUBGCP4Q9UGJ1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TUBGCP4Q9UGJ1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TUBGCP4Q9UGJ1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TUBGCP4Q9UGJ1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TUBGCP4Q9UGJ1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TUBGCP4Q9UGJ1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TUBGCP4Q9UGJ1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TUBGCP4Q9UGJ1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TUBGCP4Q9UGJ1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TUBGCP4Q9UGJ1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TUBGCP4Q9UGJ1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TUBGCP4Q9UGJ1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TUBGCP4Q9UGJ1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TUBGCP4Q9UGJ1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TUBGCP4Q9UGJ1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TUBGCP4Q9UGJ1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TUBGCP4Q9UGJ1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TUBGCP4Q9UGJ1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TUBGCP4Q9UGJ1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TUBGCP4Q9UGJ1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TUBGCP4Q9UGJ1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TUBGCP4Q9UGJ1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TUBGCP4Q9UGJ1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TUBGCP4Q9UGJ1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TUBGCP4Q9UGJ1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TUBGCP4Q9UGJ1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TUBGCP4Q9UGJ1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TUBGCP4Q9UGJ1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TUBGCP4Q9UGJ1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms