Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DKK3Q9UBP4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DKK3Q9UBP4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DKK3Q9UBP4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DKK3Q9UBP4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DKK3Q9UBP4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
DKK3Q9UBP4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DKK3Q9UBP4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DKK3Q9UBP4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DKK3Q9UBP4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DKK3Q9UBP4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DKK3Q9UBP4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
DKK3Q9UBP4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DKK3Q9UBP4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DKK3Q9UBP4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DKK3Q9UBP4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DKK3Q9UBP4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DKK3Q9UBP4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DKK3Q9UBP4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DKK3Q9UBP4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DKK3Q9UBP4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DKK3Q9UBP4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DKK3Q9UBP4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DKK3Q9UBP4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DKK3Q9UBP4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DKK3Q9UBP4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DKK3Q9UBP4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DKK3Q9UBP4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DKK3Q9UBP4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DKK3Q9UBP4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DKK3Q9UBP4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DKK3Q9UBP4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DKK3Q9UBP4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
DKK3Q9UBP4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DKK3Q9UBP4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DKK3Q9UBP4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DKK3Q9UBP4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DKK3Q9UBP4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DKK3Q9UBP4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DKK3Q9UBP4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DKK3Q9UBP4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DKK3Q9UBP4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DKK3Q9UBP4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DKK3Q9UBP4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DKK3Q9UBP4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
DKK3Q9UBP4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DKK3Q9UBP4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DKK3Q9UBP4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DKK3Q9UBP4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DKK3Q9UBP4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
DKK3Q9UBP4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
DKK3Q9UBP4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DKK3Q9UBP4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DKK3Q9UBP4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DKK3Q9UBP4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DKK3Q9UBP4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DKK3Q9UBP4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DKK3Q9UBP4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DKK3Q9UBP4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DKK3Q9UBP4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DKK3Q9UBP4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DKK3Q9UBP4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DKK3Q9UBP4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
DKK3Q9UBP4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DKK3Q9UBP4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DKK3Q9UBP4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DKK3Q9UBP4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
DKK3Q9UBP4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DKK3Q9UBP4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DKK3Q9UBP4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DKK3Q9UBP4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DKK3Q9UBP4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DKK3Q9UBP4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DKK3Q9UBP4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DKK3Q9UBP4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
DKK3Q9UBP4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
DKK3Q9UBP4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
DKK3Q9UBP4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DKK3Q9UBP4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DKK3Q9UBP4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DKK3Q9UBP4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DKK3Q9UBP4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DKK3Q9UBP4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DKK3Q9UBP4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DKK3Q9UBP4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DKK3Q9UBP4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DKK3Q9UBP4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DKK3Q9UBP4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DKK3Q9UBP4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DKK3Q9UBP4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DKK3Q9UBP4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DKK3Q9UBP4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DKK3Q9UBP4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DKK3Q9UBP4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DKK3Q9UBP4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DKK3Q9UBP4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DKK3Q9UBP4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DKK3Q9UBP4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DKK3Q9UBP4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DKK3Q9UBP4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms