Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC7

GALP, Galanin-like peptide, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALPQ9UBC7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GALPQ9UBC7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GALPQ9UBC7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GALPQ9UBC7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GALPQ9UBC7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GALPQ9UBC7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GALPQ9UBC7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GALPQ9UBC7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GALPQ9UBC7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GALPQ9UBC7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GALPQ9UBC7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GALPQ9UBC7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GALPQ9UBC7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GALPQ9UBC7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GALPQ9UBC7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GALPQ9UBC7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GALPQ9UBC7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GALPQ9UBC7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GALPQ9UBC7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GALPQ9UBC7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GALPQ9UBC7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GALPQ9UBC7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GALPQ9UBC7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GALPQ9UBC7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GALPQ9UBC7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GALPQ9UBC7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GALPQ9UBC7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GALPQ9UBC7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GALPQ9UBC7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GALPQ9UBC7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GALPQ9UBC7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GALPQ9UBC7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GALPQ9UBC7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GALPQ9UBC7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GALPQ9UBC7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GALPQ9UBC7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GALPQ9UBC7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GALPQ9UBC7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GALPQ9UBC7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GALPQ9UBC7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GALPQ9UBC7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GALPQ9UBC7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GALPQ9UBC7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GALPQ9UBC7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GALPQ9UBC7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GALPQ9UBC7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GALPQ9UBC7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GALPQ9UBC7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GALPQ9UBC7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GALPQ9UBC7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GALPQ9UBC7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GALPQ9UBC7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GALPQ9UBC7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GALPQ9UBC7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GALPQ9UBC7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GALPQ9UBC7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GALPQ9UBC7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GALPQ9UBC7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GALPQ9UBC7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GALPQ9UBC7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GALPQ9UBC7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GALPQ9UBC7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GALPQ9UBC7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GALPQ9UBC7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GALPQ9UBC7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GALPQ9UBC7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GALPQ9UBC7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GALPQ9UBC7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GALPQ9UBC7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GALPQ9UBC7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GALPQ9UBC7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GALPQ9UBC7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GALPQ9UBC7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GALPQ9UBC7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GALPQ9UBC7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GALPQ9UBC7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GALPQ9UBC7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GALPQ9UBC7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
GALPQ9UBC7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GALPQ9UBC7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GALPQ9UBC7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GALPQ9UBC7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GALPQ9UBC7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GALPQ9UBC7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GALPQ9UBC7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GALPQ9UBC7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GALPQ9UBC7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GALPQ9UBC7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GALPQ9UBC7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GALPQ9UBC7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GALPQ9UBC7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GALPQ9UBC7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GALPQ9UBC7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GALPQ9UBC7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GALPQ9UBC7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GALPQ9UBC7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GALPQ9UBC7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GALPQ9UBC7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GALPQ9UBC7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GALPQ9UBC7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms