Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB5

MBD2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD2Q9UBB5 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MBD2Q9UBB5 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MBD2Q9UBB5 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MBD2Q9UBB5 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MBD2Q9UBB5 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MBD2Q9UBB5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MBD2Q9UBB5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MBD2Q9UBB5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MBD2Q9UBB5 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MBD2Q9UBB5 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MBD2Q9UBB5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MBD2Q9UBB5 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MBD2Q9UBB5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MBD2Q9UBB5 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MBD2Q9UBB5 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MBD2Q9UBB5 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MBD2Q9UBB5 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MBD2Q9UBB5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
MBD2Q9UBB5 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MBD2Q9UBB5 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MBD2Q9UBB5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MBD2Q9UBB5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MBD2Q9UBB5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MBD2Q9UBB5 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MBD2Q9UBB5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MBD2Q9UBB5 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MBD2Q9UBB5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MBD2Q9UBB5 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MBD2Q9UBB5 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MBD2Q9UBB5 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MBD2Q9UBB5 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MBD2Q9UBB5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MBD2Q9UBB5 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MBD2Q9UBB5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MBD2Q9UBB5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MBD2Q9UBB5 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MBD2Q9UBB5 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MBD2Q9UBB5 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MBD2Q9UBB5 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MBD2Q9UBB5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MBD2Q9UBB5 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MBD2Q9UBB5 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MBD2Q9UBB5 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MBD2Q9UBB5 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MBD2Q9UBB5 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MBD2Q9UBB5 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MBD2Q9UBB5 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MBD2Q9UBB5 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MBD2Q9UBB5 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
MBD2Q9UBB5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MBD2Q9UBB5 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MBD2Q9UBB5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MBD2Q9UBB5 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MBD2Q9UBB5 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MBD2Q9UBB5 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MBD2Q9UBB5 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MBD2Q9UBB5 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MBD2Q9UBB5 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MBD2Q9UBB5 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MBD2Q9UBB5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MBD2Q9UBB5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MBD2Q9UBB5 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MBD2Q9UBB5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MBD2Q9UBB5 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MBD2Q9UBB5 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MBD2Q9UBB5 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MBD2Q9UBB5 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MBD2Q9UBB5 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MBD2Q9UBB5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MBD2Q9UBB5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MBD2Q9UBB5 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MBD2Q9UBB5 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MBD2Q9UBB5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MBD2Q9UBB5 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MBD2Q9UBB5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MBD2Q9UBB5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MBD2Q9UBB5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MBD2Q9UBB5 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MBD2Q9UBB5 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MBD2Q9UBB5 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MBD2Q9UBB5 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MBD2Q9UBB5 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MBD2Q9UBB5 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MBD2Q9UBB5 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MBD2Q9UBB5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MBD2Q9UBB5 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MBD2Q9UBB5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MBD2Q9UBB5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MBD2Q9UBB5 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MBD2Q9UBB5 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MBD2Q9UBB5 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MBD2Q9UBB5 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MBD2Q9UBB5 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MBD2Q9UBB5 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MBD2Q9UBB5 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MBD2Q9UBB5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MBD2Q9UBB5 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MBD2Q9UBB5 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MBD2Q9UBB5 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MBD2Q9UBB5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms