Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB4

ATXN10, Ataxin-10, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN10Q9UBB4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATXN10Q9UBB4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATXN10Q9UBB4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATXN10Q9UBB4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATXN10Q9UBB4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATXN10Q9UBB4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATXN10Q9UBB4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATXN10Q9UBB4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATXN10Q9UBB4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ATXN10Q9UBB4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATXN10Q9UBB4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATXN10Q9UBB4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ATXN10Q9UBB4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATXN10Q9UBB4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATXN10Q9UBB4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATXN10Q9UBB4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ATXN10Q9UBB4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATXN10Q9UBB4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATXN10Q9UBB4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ATXN10Q9UBB4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATXN10Q9UBB4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ATXN10Q9UBB4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATXN10Q9UBB4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ATXN10Q9UBB4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATXN10Q9UBB4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATXN10Q9UBB4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATXN10Q9UBB4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATXN10Q9UBB4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATXN10Q9UBB4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATXN10Q9UBB4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATXN10Q9UBB4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATXN10Q9UBB4 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATXN10Q9UBB4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATXN10Q9UBB4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ATXN10Q9UBB4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATXN10Q9UBB4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATXN10Q9UBB4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATXN10Q9UBB4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATXN10Q9UBB4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATXN10Q9UBB4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATXN10Q9UBB4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATXN10Q9UBB4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATXN10Q9UBB4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATXN10Q9UBB4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ATXN10Q9UBB4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATXN10Q9UBB4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATXN10Q9UBB4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATXN10Q9UBB4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ATXN10Q9UBB4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATXN10Q9UBB4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATXN10Q9UBB4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATXN10Q9UBB4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATXN10Q9UBB4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATXN10Q9UBB4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATXN10Q9UBB4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATXN10Q9UBB4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATXN10Q9UBB4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ATXN10Q9UBB4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATXN10Q9UBB4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATXN10Q9UBB4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATXN10Q9UBB4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATXN10Q9UBB4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATXN10Q9UBB4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATXN10Q9UBB4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATXN10Q9UBB4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATXN10Q9UBB4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATXN10Q9UBB4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATXN10Q9UBB4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATXN10Q9UBB4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATXN10Q9UBB4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
ATXN10Q9UBB4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATXN10Q9UBB4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATXN10Q9UBB4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATXN10Q9UBB4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATXN10Q9UBB4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATXN10Q9UBB4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ATXN10Q9UBB4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ATXN10Q9UBB4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ATXN10Q9UBB4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ATXN10Q9UBB4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ATXN10Q9UBB4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATXN10Q9UBB4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATXN10Q9UBB4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATXN10Q9UBB4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN10Q9UBB4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN10Q9UBB4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN10Q9UBB4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN10Q9UBB4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN10Q9UBB4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN10Q9UBB4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN10Q9UBB4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN10Q9UBB4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN10Q9UBB4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN10Q9UBB4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN10Q9UBB4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN10Q9UBB4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN10Q9UBB4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN10Q9UBB4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN10Q9UBB4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN10Q9UBB4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.4 ms