Protein–RNA interactions for Protein: Q9QC07

ERVK-18, Endogenous retrovirus group K member 18 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-18Q9QC07 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVK-18Q9QC07 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVK-18Q9QC07 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVK-18Q9QC07 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVK-18Q9QC07 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVK-18Q9QC07 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVK-18Q9QC07 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVK-18Q9QC07 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVK-18Q9QC07 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVK-18Q9QC07 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVK-18Q9QC07 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVK-18Q9QC07 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVK-18Q9QC07 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVK-18Q9QC07 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVK-18Q9QC07 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVK-18Q9QC07 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVK-18Q9QC07 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVK-18Q9QC07 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVK-18Q9QC07 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVK-18Q9QC07 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVK-18Q9QC07 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVK-18Q9QC07 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVK-18Q9QC07 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVK-18Q9QC07 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVK-18Q9QC07 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVK-18Q9QC07 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVK-18Q9QC07 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVK-18Q9QC07 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVK-18Q9QC07 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVK-18Q9QC07 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVK-18Q9QC07 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVK-18Q9QC07 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVK-18Q9QC07 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVK-18Q9QC07 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVK-18Q9QC07 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVK-18Q9QC07 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVK-18Q9QC07 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVK-18Q9QC07 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVK-18Q9QC07 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVK-18Q9QC07 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVK-18Q9QC07 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVK-18Q9QC07 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVK-18Q9QC07 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVK-18Q9QC07 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVK-18Q9QC07 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVK-18Q9QC07 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVK-18Q9QC07 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVK-18Q9QC07 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVK-18Q9QC07 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK-18Q9QC07 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK-18Q9QC07 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK-18Q9QC07 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK-18Q9QC07 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK-18Q9QC07 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK-18Q9QC07 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK-18Q9QC07 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK-18Q9QC07 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK-18Q9QC07 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK-18Q9QC07 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK-18Q9QC07 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK-18Q9QC07 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK-18Q9QC07 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK-18Q9QC07 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK-18Q9QC07 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK-18Q9QC07 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVK-18Q9QC07 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVK-18Q9QC07 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVK-18Q9QC07 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVK-18Q9QC07 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVK-18Q9QC07 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVK-18Q9QC07 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVK-18Q9QC07 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVK-18Q9QC07 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVK-18Q9QC07 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVK-18Q9QC07 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVK-18Q9QC07 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVK-18Q9QC07 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVK-18Q9QC07 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVK-18Q9QC07 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVK-18Q9QC07 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVK-18Q9QC07 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVK-18Q9QC07 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVK-18Q9QC07 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVK-18Q9QC07 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVK-18Q9QC07 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVK-18Q9QC07 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVK-18Q9QC07 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVK-18Q9QC07 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVK-18Q9QC07 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVK-18Q9QC07 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVK-18Q9QC07 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVK-18Q9QC07 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVK-18Q9QC07 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVK-18Q9QC07 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVK-18Q9QC07 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVK-18Q9QC07 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ERVK-18Q9QC07 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ERVK-18Q9QC07 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ERVK-18Q9QC07 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVK-18Q9QC07 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.6 ms