Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J5

LARS, Leucine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARSQ9P2J5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LARSQ9P2J5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LARSQ9P2J5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LARSQ9P2J5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LARSQ9P2J5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LARSQ9P2J5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LARSQ9P2J5 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LARSQ9P2J5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LARSQ9P2J5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LARSQ9P2J5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LARSQ9P2J5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LARSQ9P2J5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LARSQ9P2J5 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LARSQ9P2J5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LARSQ9P2J5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LARSQ9P2J5 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LARSQ9P2J5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LARSQ9P2J5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LARSQ9P2J5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LARSQ9P2J5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LARSQ9P2J5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LARSQ9P2J5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
LARSQ9P2J5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LARSQ9P2J5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LARSQ9P2J5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LARSQ9P2J5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LARSQ9P2J5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LARSQ9P2J5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LARSQ9P2J5 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LARSQ9P2J5 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LARSQ9P2J5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LARSQ9P2J5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LARSQ9P2J5 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LARSQ9P2J5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LARSQ9P2J5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LARSQ9P2J5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LARSQ9P2J5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LARSQ9P2J5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LARSQ9P2J5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LARSQ9P2J5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LARSQ9P2J5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LARSQ9P2J5 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LARSQ9P2J5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LARSQ9P2J5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LARSQ9P2J5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LARSQ9P2J5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LARSQ9P2J5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LARSQ9P2J5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LARSQ9P2J5 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LARSQ9P2J5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LARSQ9P2J5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LARSQ9P2J5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LARSQ9P2J5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LARSQ9P2J5 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LARSQ9P2J5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LARSQ9P2J5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LARSQ9P2J5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LARSQ9P2J5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LARSQ9P2J5 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LARSQ9P2J5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LARSQ9P2J5 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LARSQ9P2J5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LARSQ9P2J5 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LARSQ9P2J5 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LARSQ9P2J5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LARSQ9P2J5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LARSQ9P2J5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LARSQ9P2J5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LARSQ9P2J5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LARSQ9P2J5 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LARSQ9P2J5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LARSQ9P2J5 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LARSQ9P2J5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LARSQ9P2J5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LARSQ9P2J5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LARSQ9P2J5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LARSQ9P2J5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LARSQ9P2J5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LARSQ9P2J5 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LARSQ9P2J5 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LARSQ9P2J5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LARSQ9P2J5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LARSQ9P2J5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LARSQ9P2J5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LARSQ9P2J5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LARSQ9P2J5 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LARSQ9P2J5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LARSQ9P2J5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LARSQ9P2J5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LARSQ9P2J5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LARSQ9P2J5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LARSQ9P2J5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LARSQ9P2J5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LARSQ9P2J5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LARSQ9P2J5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LARSQ9P2J5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LARSQ9P2J5 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LARSQ9P2J5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LARSQ9P2J5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LARSQ9P2J5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms