Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ71

RTEL1, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1Q9NZ71 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RTEL1Q9NZ71 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RTEL1Q9NZ71 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RTEL1Q9NZ71 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RTEL1Q9NZ71 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RTEL1Q9NZ71 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RTEL1Q9NZ71 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RTEL1Q9NZ71 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RTEL1Q9NZ71 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RTEL1Q9NZ71 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RTEL1Q9NZ71 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RTEL1Q9NZ71 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RTEL1Q9NZ71 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RTEL1Q9NZ71 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RTEL1Q9NZ71 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RTEL1Q9NZ71 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RTEL1Q9NZ71 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RTEL1Q9NZ71 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RTEL1Q9NZ71 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RTEL1Q9NZ71 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RTEL1Q9NZ71 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RTEL1Q9NZ71 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RTEL1Q9NZ71 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RTEL1Q9NZ71 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RTEL1Q9NZ71 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RTEL1Q9NZ71 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RTEL1Q9NZ71 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RTEL1Q9NZ71 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RTEL1Q9NZ71 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RTEL1Q9NZ71 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RTEL1Q9NZ71 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RTEL1Q9NZ71 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RTEL1Q9NZ71 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RTEL1Q9NZ71 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
RTEL1Q9NZ71 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RTEL1Q9NZ71 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RTEL1Q9NZ71 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RTEL1Q9NZ71 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RTEL1Q9NZ71 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RTEL1Q9NZ71 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RTEL1Q9NZ71 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
RTEL1Q9NZ71 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RTEL1Q9NZ71 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RTEL1Q9NZ71 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
RTEL1Q9NZ71 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RTEL1Q9NZ71 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RTEL1Q9NZ71 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RTEL1Q9NZ71 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RTEL1Q9NZ71 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RTEL1Q9NZ71 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RTEL1Q9NZ71 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RTEL1Q9NZ71 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RTEL1Q9NZ71 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RTEL1Q9NZ71 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RTEL1Q9NZ71 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RTEL1Q9NZ71 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RTEL1Q9NZ71 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RTEL1Q9NZ71 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RTEL1Q9NZ71 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RTEL1Q9NZ71 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
RTEL1Q9NZ71 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RTEL1Q9NZ71 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
RTEL1Q9NZ71 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RTEL1Q9NZ71 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RTEL1Q9NZ71 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RTEL1Q9NZ71 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
RTEL1Q9NZ71 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RTEL1Q9NZ71 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RTEL1Q9NZ71 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RTEL1Q9NZ71 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RTEL1Q9NZ71 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RTEL1Q9NZ71 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RTEL1Q9NZ71 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RTEL1Q9NZ71 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RTEL1Q9NZ71 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RTEL1Q9NZ71 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RTEL1Q9NZ71 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
RTEL1Q9NZ71 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
RTEL1Q9NZ71 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RTEL1Q9NZ71 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RTEL1Q9NZ71 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RTEL1Q9NZ71 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RTEL1Q9NZ71 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RTEL1Q9NZ71 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RTEL1Q9NZ71 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RTEL1Q9NZ71 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RTEL1Q9NZ71 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RTEL1Q9NZ71 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RTEL1Q9NZ71 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RTEL1Q9NZ71 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
RTEL1Q9NZ71 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RTEL1Q9NZ71 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RTEL1Q9NZ71 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RTEL1Q9NZ71 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RTEL1Q9NZ71 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RTEL1Q9NZ71 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RTEL1Q9NZ71 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RTEL1Q9NZ71 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RTEL1Q9NZ71 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
RTEL1Q9NZ71 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms