Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL28Q9NXS3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL28Q9NXS3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL28Q9NXS3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL28Q9NXS3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL28Q9NXS3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL28Q9NXS3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL28Q9NXS3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL28Q9NXS3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL28Q9NXS3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL28Q9NXS3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL28Q9NXS3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL28Q9NXS3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL28Q9NXS3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL28Q9NXS3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL28Q9NXS3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL28Q9NXS3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL28Q9NXS3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL28Q9NXS3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL28Q9NXS3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL28Q9NXS3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL28Q9NXS3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL28Q9NXS3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL28Q9NXS3 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL28Q9NXS3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL28Q9NXS3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL28Q9NXS3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL28Q9NXS3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL28Q9NXS3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL28Q9NXS3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL28Q9NXS3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL28Q9NXS3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL28Q9NXS3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL28Q9NXS3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL28Q9NXS3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL28Q9NXS3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL28Q9NXS3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL28Q9NXS3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL28Q9NXS3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL28Q9NXS3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL28Q9NXS3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL28Q9NXS3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL28Q9NXS3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL28Q9NXS3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL28Q9NXS3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL28Q9NXS3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL28Q9NXS3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KLHL28Q9NXS3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
KLHL28Q9NXS3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
KLHL28Q9NXS3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
KLHL28Q9NXS3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KLHL28Q9NXS3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL28Q9NXS3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL28Q9NXS3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL28Q9NXS3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL28Q9NXS3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL28Q9NXS3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL28Q9NXS3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL28Q9NXS3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL28Q9NXS3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL28Q9NXS3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL28Q9NXS3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL28Q9NXS3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL28Q9NXS3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL28Q9NXS3 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL28Q9NXS3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL28Q9NXS3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL28Q9NXS3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL28Q9NXS3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL28Q9NXS3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL28Q9NXS3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL28Q9NXS3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL28Q9NXS3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL28Q9NXS3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL28Q9NXS3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL28Q9NXS3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL28Q9NXS3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL28Q9NXS3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL28Q9NXS3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL28Q9NXS3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL28Q9NXS3 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL28Q9NXS3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL28Q9NXS3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL28Q9NXS3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL28Q9NXS3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL28Q9NXS3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL28Q9NXS3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL28Q9NXS3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL28Q9NXS3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL28Q9NXS3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL28Q9NXS3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL28Q9NXS3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL28Q9NXS3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL28Q9NXS3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL28Q9NXS3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL28Q9NXS3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL28Q9NXS3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL28Q9NXS3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL28Q9NXS3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL28Q9NXS3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.4 ms