Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVX2

NLE1, Notchless protein homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLE1Q9NVX2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLE1Q9NVX2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLE1Q9NVX2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLE1Q9NVX2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLE1Q9NVX2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLE1Q9NVX2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLE1Q9NVX2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLE1Q9NVX2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLE1Q9NVX2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLE1Q9NVX2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLE1Q9NVX2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLE1Q9NVX2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLE1Q9NVX2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLE1Q9NVX2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLE1Q9NVX2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLE1Q9NVX2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLE1Q9NVX2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLE1Q9NVX2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLE1Q9NVX2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NLE1Q9NVX2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLE1Q9NVX2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLE1Q9NVX2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLE1Q9NVX2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLE1Q9NVX2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLE1Q9NVX2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NLE1Q9NVX2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLE1Q9NVX2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLE1Q9NVX2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLE1Q9NVX2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLE1Q9NVX2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLE1Q9NVX2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLE1Q9NVX2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLE1Q9NVX2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLE1Q9NVX2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLE1Q9NVX2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLE1Q9NVX2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NLE1Q9NVX2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLE1Q9NVX2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLE1Q9NVX2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLE1Q9NVX2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLE1Q9NVX2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLE1Q9NVX2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLE1Q9NVX2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLE1Q9NVX2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLE1Q9NVX2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLE1Q9NVX2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLE1Q9NVX2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLE1Q9NVX2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLE1Q9NVX2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NLE1Q9NVX2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NLE1Q9NVX2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NLE1Q9NVX2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NLE1Q9NVX2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLE1Q9NVX2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NLE1Q9NVX2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLE1Q9NVX2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLE1Q9NVX2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLE1Q9NVX2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLE1Q9NVX2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLE1Q9NVX2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLE1Q9NVX2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLE1Q9NVX2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLE1Q9NVX2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLE1Q9NVX2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NLE1Q9NVX2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NLE1Q9NVX2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NLE1Q9NVX2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLE1Q9NVX2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLE1Q9NVX2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLE1Q9NVX2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLE1Q9NVX2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLE1Q9NVX2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLE1Q9NVX2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NLE1Q9NVX2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLE1Q9NVX2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NLE1Q9NVX2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLE1Q9NVX2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLE1Q9NVX2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLE1Q9NVX2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLE1Q9NVX2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLE1Q9NVX2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLE1Q9NVX2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLE1Q9NVX2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLE1Q9NVX2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLE1Q9NVX2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLE1Q9NVX2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLE1Q9NVX2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLE1Q9NVX2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLE1Q9NVX2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLE1Q9NVX2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NLE1Q9NVX2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLE1Q9NVX2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLE1Q9NVX2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLE1Q9NVX2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLE1Q9NVX2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLE1Q9NVX2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLE1Q9NVX2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLE1Q9NVX2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLE1Q9NVX2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLE1Q9NVX2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms