Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUQ8

ABCF3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF3Q9NUQ8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCF3Q9NUQ8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCF3Q9NUQ8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCF3Q9NUQ8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCF3Q9NUQ8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCF3Q9NUQ8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCF3Q9NUQ8 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCF3Q9NUQ8 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCF3Q9NUQ8 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCF3Q9NUQ8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCF3Q9NUQ8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCF3Q9NUQ8 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCF3Q9NUQ8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCF3Q9NUQ8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCF3Q9NUQ8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCF3Q9NUQ8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCF3Q9NUQ8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCF3Q9NUQ8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCF3Q9NUQ8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCF3Q9NUQ8 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCF3Q9NUQ8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCF3Q9NUQ8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCF3Q9NUQ8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCF3Q9NUQ8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCF3Q9NUQ8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCF3Q9NUQ8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCF3Q9NUQ8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCF3Q9NUQ8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCF3Q9NUQ8 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCF3Q9NUQ8 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCF3Q9NUQ8 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCF3Q9NUQ8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCF3Q9NUQ8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCF3Q9NUQ8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCF3Q9NUQ8 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCF3Q9NUQ8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCF3Q9NUQ8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCF3Q9NUQ8 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCF3Q9NUQ8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCF3Q9NUQ8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCF3Q9NUQ8 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCF3Q9NUQ8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCF3Q9NUQ8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCF3Q9NUQ8 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCF3Q9NUQ8 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCF3Q9NUQ8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCF3Q9NUQ8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCF3Q9NUQ8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCF3Q9NUQ8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCF3Q9NUQ8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCF3Q9NUQ8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCF3Q9NUQ8 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCF3Q9NUQ8 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCF3Q9NUQ8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCF3Q9NUQ8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCF3Q9NUQ8 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ABCF3Q9NUQ8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCF3Q9NUQ8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCF3Q9NUQ8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCF3Q9NUQ8 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCF3Q9NUQ8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCF3Q9NUQ8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCF3Q9NUQ8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCF3Q9NUQ8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCF3Q9NUQ8 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCF3Q9NUQ8 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCF3Q9NUQ8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCF3Q9NUQ8 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCF3Q9NUQ8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCF3Q9NUQ8 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCF3Q9NUQ8 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCF3Q9NUQ8 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCF3Q9NUQ8 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCF3Q9NUQ8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCF3Q9NUQ8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCF3Q9NUQ8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCF3Q9NUQ8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCF3Q9NUQ8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCF3Q9NUQ8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCF3Q9NUQ8 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCF3Q9NUQ8 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCF3Q9NUQ8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCF3Q9NUQ8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCF3Q9NUQ8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCF3Q9NUQ8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCF3Q9NUQ8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCF3Q9NUQ8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCF3Q9NUQ8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCF3Q9NUQ8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCF3Q9NUQ8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCF3Q9NUQ8 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCF3Q9NUQ8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCF3Q9NUQ8 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCF3Q9NUQ8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCF3Q9NUQ8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCF3Q9NUQ8 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCF3Q9NUQ8 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCF3Q9NUQ8 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCF3Q9NUQ8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCF3Q9NUQ8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms