Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LMBRD1Q9NUN5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LMBRD1Q9NUN5 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMBRD1Q9NUN5 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMBRD1Q9NUN5 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMBRD1Q9NUN5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMBRD1Q9NUN5 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMBRD1Q9NUN5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
LMBRD1Q9NUN5 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
LMBRD1Q9NUN5 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMBRD1Q9NUN5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMBRD1Q9NUN5 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMBRD1Q9NUN5 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMBRD1Q9NUN5 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMBRD1Q9NUN5 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMBRD1Q9NUN5 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMBRD1Q9NUN5 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMBRD1Q9NUN5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMBRD1Q9NUN5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMBRD1Q9NUN5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMBRD1Q9NUN5 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMBRD1Q9NUN5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LMBRD1Q9NUN5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LMBRD1Q9NUN5 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LMBRD1Q9NUN5 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LMBRD1Q9NUN5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LMBRD1Q9NUN5 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LMBRD1Q9NUN5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LMBRD1Q9NUN5 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LMBRD1Q9NUN5 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LMBRD1Q9NUN5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LMBRD1Q9NUN5 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMBRD1Q9NUN5 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMBRD1Q9NUN5 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMBRD1Q9NUN5 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMBRD1Q9NUN5 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMBRD1Q9NUN5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMBRD1Q9NUN5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMBRD1Q9NUN5 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMBRD1Q9NUN5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMBRD1Q9NUN5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMBRD1Q9NUN5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMBRD1Q9NUN5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMBRD1Q9NUN5 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMBRD1Q9NUN5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
LMBRD1Q9NUN5 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LMBRD1Q9NUN5 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LMBRD1Q9NUN5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LMBRD1Q9NUN5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
LMBRD1Q9NUN5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LMBRD1Q9NUN5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LMBRD1Q9NUN5 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LMBRD1Q9NUN5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMBRD1Q9NUN5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMBRD1Q9NUN5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMBRD1Q9NUN5 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMBRD1Q9NUN5 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMBRD1Q9NUN5 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMBRD1Q9NUN5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMBRD1Q9NUN5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMBRD1Q9NUN5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMBRD1Q9NUN5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
LMBRD1Q9NUN5 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMBRD1Q9NUN5 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMBRD1Q9NUN5 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMBRD1Q9NUN5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMBRD1Q9NUN5 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMBRD1Q9NUN5 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMBRD1Q9NUN5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMBRD1Q9NUN5 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMBRD1Q9NUN5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMBRD1Q9NUN5 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMBRD1Q9NUN5 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMBRD1Q9NUN5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMBRD1Q9NUN5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMBRD1Q9NUN5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMBRD1Q9NUN5 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
LMBRD1Q9NUN5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMBRD1Q9NUN5 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMBRD1Q9NUN5 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMBRD1Q9NUN5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMBRD1Q9NUN5 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMBRD1Q9NUN5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMBRD1Q9NUN5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMBRD1Q9NUN5 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMBRD1Q9NUN5 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMBRD1Q9NUN5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
LMBRD1Q9NUN5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMBRD1Q9NUN5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
LMBRD1Q9NUN5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
LMBRD1Q9NUN5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMBRD1Q9NUN5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMBRD1Q9NUN5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMBRD1Q9NUN5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMBRD1Q9NUN5 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMBRD1Q9NUN5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMBRD1Q9NUN5 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMBRD1Q9NUN5 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMBRD1Q9NUN5 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LMBRD1Q9NUN5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms