Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CENPMQ9NSP4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CENPMQ9NSP4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CENPMQ9NSP4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CENPMQ9NSP4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CENPMQ9NSP4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CENPMQ9NSP4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CENPMQ9NSP4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CENPMQ9NSP4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CENPMQ9NSP4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CENPMQ9NSP4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CENPMQ9NSP4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CENPMQ9NSP4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CENPMQ9NSP4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CENPMQ9NSP4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CENPMQ9NSP4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CENPMQ9NSP4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CENPMQ9NSP4 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CENPMQ9NSP4 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CENPMQ9NSP4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CENPMQ9NSP4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CENPMQ9NSP4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CENPMQ9NSP4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CENPMQ9NSP4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CENPMQ9NSP4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CENPMQ9NSP4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CENPMQ9NSP4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CENPMQ9NSP4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CENPMQ9NSP4 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CENPMQ9NSP4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CENPMQ9NSP4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CENPMQ9NSP4 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CENPMQ9NSP4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CENPMQ9NSP4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CENPMQ9NSP4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CENPMQ9NSP4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CENPMQ9NSP4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CENPMQ9NSP4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CENPMQ9NSP4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CENPMQ9NSP4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CENPMQ9NSP4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CENPMQ9NSP4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CENPMQ9NSP4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CENPMQ9NSP4 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CENPMQ9NSP4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CENPMQ9NSP4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CENPMQ9NSP4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CENPMQ9NSP4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CENPMQ9NSP4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CENPMQ9NSP4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CENPMQ9NSP4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CENPMQ9NSP4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CENPMQ9NSP4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CENPMQ9NSP4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CENPMQ9NSP4 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CENPMQ9NSP4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CENPMQ9NSP4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CENPMQ9NSP4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CENPMQ9NSP4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CENPMQ9NSP4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CENPMQ9NSP4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CENPMQ9NSP4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CENPMQ9NSP4 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CENPMQ9NSP4 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CENPMQ9NSP4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CENPMQ9NSP4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CENPMQ9NSP4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CENPMQ9NSP4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CENPMQ9NSP4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CENPMQ9NSP4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CENPMQ9NSP4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CENPMQ9NSP4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CENPMQ9NSP4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CENPMQ9NSP4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CENPMQ9NSP4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CENPMQ9NSP4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CENPMQ9NSP4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CENPMQ9NSP4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CENPMQ9NSP4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CENPMQ9NSP4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CENPMQ9NSP4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CENPMQ9NSP4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CENPMQ9NSP4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPMQ9NSP4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPMQ9NSP4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPMQ9NSP4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPMQ9NSP4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPMQ9NSP4 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPMQ9NSP4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPMQ9NSP4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPMQ9NSP4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPMQ9NSP4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPMQ9NSP4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPMQ9NSP4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPMQ9NSP4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPMQ9NSP4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPMQ9NSP4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPMQ9NSP4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPMQ9NSP4 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPMQ9NSP4 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms