Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW7

VPS45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS45Q9NRW7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS45Q9NRW7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS45Q9NRW7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS45Q9NRW7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS45Q9NRW7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS45Q9NRW7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS45Q9NRW7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS45Q9NRW7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS45Q9NRW7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS45Q9NRW7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS45Q9NRW7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS45Q9NRW7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS45Q9NRW7 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS45Q9NRW7 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS45Q9NRW7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS45Q9NRW7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS45Q9NRW7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS45Q9NRW7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS45Q9NRW7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS45Q9NRW7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS45Q9NRW7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS45Q9NRW7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS45Q9NRW7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS45Q9NRW7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS45Q9NRW7 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS45Q9NRW7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS45Q9NRW7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS45Q9NRW7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS45Q9NRW7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS45Q9NRW7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS45Q9NRW7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS45Q9NRW7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS45Q9NRW7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS45Q9NRW7 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS45Q9NRW7 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS45Q9NRW7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS45Q9NRW7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS45Q9NRW7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS45Q9NRW7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS45Q9NRW7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS45Q9NRW7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS45Q9NRW7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS45Q9NRW7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS45Q9NRW7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS45Q9NRW7 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS45Q9NRW7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS45Q9NRW7 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS45Q9NRW7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS45Q9NRW7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS45Q9NRW7 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS45Q9NRW7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS45Q9NRW7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS45Q9NRW7 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS45Q9NRW7 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS45Q9NRW7 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS45Q9NRW7 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS45Q9NRW7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS45Q9NRW7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS45Q9NRW7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS45Q9NRW7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS45Q9NRW7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS45Q9NRW7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS45Q9NRW7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS45Q9NRW7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS45Q9NRW7 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS45Q9NRW7 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS45Q9NRW7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS45Q9NRW7 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS45Q9NRW7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS45Q9NRW7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS45Q9NRW7 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS45Q9NRW7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS45Q9NRW7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS45Q9NRW7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS45Q9NRW7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS45Q9NRW7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS45Q9NRW7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS45Q9NRW7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS45Q9NRW7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS45Q9NRW7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS45Q9NRW7 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS45Q9NRW7 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS45Q9NRW7 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS45Q9NRW7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS45Q9NRW7 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS45Q9NRW7 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS45Q9NRW7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS45Q9NRW7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS45Q9NRW7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS45Q9NRW7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS45Q9NRW7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS45Q9NRW7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS45Q9NRW7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS45Q9NRW7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS45Q9NRW7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS45Q9NRW7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS45Q9NRW7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS45Q9NRW7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS45Q9NRW7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS45Q9NRW7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms