Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR33

POLE4, DNA polymerase epsilon subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE4Q9NR33 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLE4Q9NR33 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLE4Q9NR33 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLE4Q9NR33 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLE4Q9NR33 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLE4Q9NR33 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLE4Q9NR33 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLE4Q9NR33 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLE4Q9NR33 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLE4Q9NR33 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLE4Q9NR33 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLE4Q9NR33 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLE4Q9NR33 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLE4Q9NR33 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLE4Q9NR33 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLE4Q9NR33 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
POLE4Q9NR33 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLE4Q9NR33 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLE4Q9NR33 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLE4Q9NR33 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLE4Q9NR33 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLE4Q9NR33 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLE4Q9NR33 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLE4Q9NR33 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLE4Q9NR33 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLE4Q9NR33 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLE4Q9NR33 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLE4Q9NR33 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
POLE4Q9NR33 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
POLE4Q9NR33 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLE4Q9NR33 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLE4Q9NR33 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLE4Q9NR33 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLE4Q9NR33 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLE4Q9NR33 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLE4Q9NR33 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLE4Q9NR33 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLE4Q9NR33 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLE4Q9NR33 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLE4Q9NR33 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLE4Q9NR33 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLE4Q9NR33 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLE4Q9NR33 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLE4Q9NR33 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
POLE4Q9NR33 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLE4Q9NR33 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLE4Q9NR33 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLE4Q9NR33 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLE4Q9NR33 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLE4Q9NR33 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLE4Q9NR33 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLE4Q9NR33 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLE4Q9NR33 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLE4Q9NR33 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLE4Q9NR33 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLE4Q9NR33 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLE4Q9NR33 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
POLE4Q9NR33 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLE4Q9NR33 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLE4Q9NR33 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLE4Q9NR33 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLE4Q9NR33 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLE4Q9NR33 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLE4Q9NR33 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLE4Q9NR33 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLE4Q9NR33 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLE4Q9NR33 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLE4Q9NR33 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLE4Q9NR33 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLE4Q9NR33 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLE4Q9NR33 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLE4Q9NR33 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLE4Q9NR33 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLE4Q9NR33 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLE4Q9NR33 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLE4Q9NR33 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLE4Q9NR33 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLE4Q9NR33 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLE4Q9NR33 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLE4Q9NR33 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLE4Q9NR33 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLE4Q9NR33 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLE4Q9NR33 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
POLE4Q9NR33 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLE4Q9NR33 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
POLE4Q9NR33 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLE4Q9NR33 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLE4Q9NR33 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLE4Q9NR33 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLE4Q9NR33 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLE4Q9NR33 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLE4Q9NR33 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLE4Q9NR33 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLE4Q9NR33 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLE4Q9NR33 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLE4Q9NR33 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLE4Q9NR33 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLE4Q9NR33 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLE4Q9NR33 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLE4Q9NR33 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms