Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB8

GPCPD1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GPCPD1, humanhuman

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPCPD1Q9NPB8 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GPCPD1Q9NPB8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GPCPD1Q9NPB8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GPCPD1Q9NPB8 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GPCPD1Q9NPB8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GPCPD1Q9NPB8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GPCPD1Q9NPB8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GPCPD1Q9NPB8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GPCPD1Q9NPB8 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GPCPD1Q9NPB8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GPCPD1Q9NPB8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GPCPD1Q9NPB8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GPCPD1Q9NPB8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GPCPD1Q9NPB8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GPCPD1Q9NPB8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GPCPD1Q9NPB8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GPCPD1Q9NPB8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GPCPD1Q9NPB8 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GPCPD1Q9NPB8 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GPCPD1Q9NPB8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GPCPD1Q9NPB8 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GPCPD1Q9NPB8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GPCPD1Q9NPB8 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GPCPD1Q9NPB8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GPCPD1Q9NPB8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GPCPD1Q9NPB8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
GPCPD1Q9NPB8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GPCPD1Q9NPB8 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GPCPD1Q9NPB8 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GPCPD1Q9NPB8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GPCPD1Q9NPB8 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
GPCPD1Q9NPB8 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GPCPD1Q9NPB8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GPCPD1Q9NPB8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GPCPD1Q9NPB8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GPCPD1Q9NPB8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GPCPD1Q9NPB8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GPCPD1Q9NPB8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GPCPD1Q9NPB8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GPCPD1Q9NPB8 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GPCPD1Q9NPB8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GPCPD1Q9NPB8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GPCPD1Q9NPB8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GPCPD1Q9NPB8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GPCPD1Q9NPB8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GPCPD1Q9NPB8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GPCPD1Q9NPB8 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GPCPD1Q9NPB8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GPCPD1Q9NPB8 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GPCPD1Q9NPB8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GPCPD1Q9NPB8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GPCPD1Q9NPB8 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
GPCPD1Q9NPB8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GPCPD1Q9NPB8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GPCPD1Q9NPB8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
GPCPD1Q9NPB8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GPCPD1Q9NPB8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GPCPD1Q9NPB8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GPCPD1Q9NPB8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GPCPD1Q9NPB8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GPCPD1Q9NPB8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GPCPD1Q9NPB8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
GPCPD1Q9NPB8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GPCPD1Q9NPB8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GPCPD1Q9NPB8 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GPCPD1Q9NPB8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GPCPD1Q9NPB8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GPCPD1Q9NPB8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GPCPD1Q9NPB8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GPCPD1Q9NPB8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GPCPD1Q9NPB8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GPCPD1Q9NPB8 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GPCPD1Q9NPB8 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GPCPD1Q9NPB8 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GPCPD1Q9NPB8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GPCPD1Q9NPB8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GPCPD1Q9NPB8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GPCPD1Q9NPB8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GPCPD1Q9NPB8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GPCPD1Q9NPB8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GPCPD1Q9NPB8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GPCPD1Q9NPB8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GPCPD1Q9NPB8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GPCPD1Q9NPB8 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GPCPD1Q9NPB8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GPCPD1Q9NPB8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GPCPD1Q9NPB8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GPCPD1Q9NPB8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GPCPD1Q9NPB8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GPCPD1Q9NPB8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GPCPD1Q9NPB8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GPCPD1Q9NPB8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GPCPD1Q9NPB8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GPCPD1Q9NPB8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GPCPD1Q9NPB8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GPCPD1Q9NPB8 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GPCPD1Q9NPB8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GPCPD1Q9NPB8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GPCPD1Q9NPB8 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GPCPD1Q9NPB8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms