Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCN3

TMEM8A, Post-GPI attachment to proteins factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM8AQ9HCN3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM8AQ9HCN3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM8AQ9HCN3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM8AQ9HCN3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM8AQ9HCN3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM8AQ9HCN3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM8AQ9HCN3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM8AQ9HCN3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM8AQ9HCN3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM8AQ9HCN3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM8AQ9HCN3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM8AQ9HCN3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM8AQ9HCN3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM8AQ9HCN3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM8AQ9HCN3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM8AQ9HCN3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM8AQ9HCN3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM8AQ9HCN3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM8AQ9HCN3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM8AQ9HCN3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM8AQ9HCN3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM8AQ9HCN3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM8AQ9HCN3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM8AQ9HCN3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM8AQ9HCN3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM8AQ9HCN3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM8AQ9HCN3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM8AQ9HCN3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM8AQ9HCN3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM8AQ9HCN3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM8AQ9HCN3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM8AQ9HCN3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM8AQ9HCN3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM8AQ9HCN3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM8AQ9HCN3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM8AQ9HCN3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM8AQ9HCN3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM8AQ9HCN3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM8AQ9HCN3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM8AQ9HCN3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM8AQ9HCN3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM8AQ9HCN3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM8AQ9HCN3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM8AQ9HCN3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM8AQ9HCN3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM8AQ9HCN3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM8AQ9HCN3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM8AQ9HCN3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM8AQ9HCN3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM8AQ9HCN3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM8AQ9HCN3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM8AQ9HCN3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM8AQ9HCN3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM8AQ9HCN3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TMEM8AQ9HCN3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TMEM8AQ9HCN3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMEM8AQ9HCN3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TMEM8AQ9HCN3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMEM8AQ9HCN3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMEM8AQ9HCN3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMEM8AQ9HCN3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMEM8AQ9HCN3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM8AQ9HCN3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM8AQ9HCN3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM8AQ9HCN3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM8AQ9HCN3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM8AQ9HCN3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM8AQ9HCN3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM8AQ9HCN3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM8AQ9HCN3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM8AQ9HCN3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM8AQ9HCN3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM8AQ9HCN3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM8AQ9HCN3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM8AQ9HCN3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM8AQ9HCN3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM8AQ9HCN3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM8AQ9HCN3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM8AQ9HCN3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM8AQ9HCN3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM8AQ9HCN3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM8AQ9HCN3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM8AQ9HCN3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM8AQ9HCN3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM8AQ9HCN3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM8AQ9HCN3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM8AQ9HCN3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM8AQ9HCN3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM8AQ9HCN3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM8AQ9HCN3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM8AQ9HCN3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM8AQ9HCN3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM8AQ9HCN3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM8AQ9HCN3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM8AQ9HCN3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM8AQ9HCN3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMEM8AQ9HCN3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMEM8AQ9HCN3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMEM8AQ9HCN3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TMEM8AQ9HCN3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms