Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KIAA1549Q9HCM3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KIAA1549Q9HCM3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KIAA1549Q9HCM3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KIAA1549Q9HCM3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
KIAA1549Q9HCM3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
KIAA1549Q9HCM3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
KIAA1549Q9HCM3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KIAA1549Q9HCM3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KIAA1549Q9HCM3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KIAA1549Q9HCM3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KIAA1549Q9HCM3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
KIAA1549Q9HCM3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KIAA1549Q9HCM3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KIAA1549Q9HCM3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KIAA1549Q9HCM3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KIAA1549Q9HCM3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KIAA1549Q9HCM3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KIAA1549Q9HCM3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KIAA1549Q9HCM3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KIAA1549Q9HCM3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KIAA1549Q9HCM3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KIAA1549Q9HCM3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KIAA1549Q9HCM3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KIAA1549Q9HCM3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KIAA1549Q9HCM3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KIAA1549Q9HCM3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KIAA1549Q9HCM3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KIAA1549Q9HCM3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KIAA1549Q9HCM3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KIAA1549Q9HCM3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KIAA1549Q9HCM3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KIAA1549Q9HCM3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KIAA1549Q9HCM3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KIAA1549Q9HCM3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KIAA1549Q9HCM3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KIAA1549Q9HCM3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
KIAA1549Q9HCM3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KIAA1549Q9HCM3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KIAA1549Q9HCM3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KIAA1549Q9HCM3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KIAA1549Q9HCM3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KIAA1549Q9HCM3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KIAA1549Q9HCM3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KIAA1549Q9HCM3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KIAA1549Q9HCM3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KIAA1549Q9HCM3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KIAA1549Q9HCM3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KIAA1549Q9HCM3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
KIAA1549Q9HCM3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KIAA1549Q9HCM3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KIAA1549Q9HCM3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KIAA1549Q9HCM3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KIAA1549Q9HCM3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KIAA1549Q9HCM3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KIAA1549Q9HCM3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KIAA1549Q9HCM3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KIAA1549Q9HCM3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KIAA1549Q9HCM3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KIAA1549Q9HCM3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KIAA1549Q9HCM3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KIAA1549Q9HCM3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KIAA1549Q9HCM3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
KIAA1549Q9HCM3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
KIAA1549Q9HCM3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KIAA1549Q9HCM3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KIAA1549Q9HCM3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KIAA1549Q9HCM3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KIAA1549Q9HCM3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KIAA1549Q9HCM3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KIAA1549Q9HCM3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KIAA1549Q9HCM3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KIAA1549Q9HCM3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KIAA1549Q9HCM3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KIAA1549Q9HCM3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KIAA1549Q9HCM3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KIAA1549Q9HCM3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KIAA1549Q9HCM3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KIAA1549Q9HCM3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KIAA1549Q9HCM3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KIAA1549Q9HCM3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KIAA1549Q9HCM3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KIAA1549Q9HCM3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
KIAA1549Q9HCM3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KIAA1549Q9HCM3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
KIAA1549Q9HCM3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KIAA1549Q9HCM3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KIAA1549Q9HCM3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KIAA1549Q9HCM3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KIAA1549Q9HCM3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KIAA1549Q9HCM3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
KIAA1549Q9HCM3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
KIAA1549Q9HCM3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
KIAA1549Q9HCM3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
KIAA1549Q9HCM3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
KIAA1549Q9HCM3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
KIAA1549Q9HCM3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
KIAA1549Q9HCM3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
KIAA1549Q9HCM3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
KIAA1549Q9HCM3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms