Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCG8

CWC22, Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC22Q9HCG8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CWC22Q9HCG8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CWC22Q9HCG8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CWC22Q9HCG8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CWC22Q9HCG8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CWC22Q9HCG8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CWC22Q9HCG8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CWC22Q9HCG8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CWC22Q9HCG8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CWC22Q9HCG8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CWC22Q9HCG8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CWC22Q9HCG8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CWC22Q9HCG8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CWC22Q9HCG8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CWC22Q9HCG8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CWC22Q9HCG8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CWC22Q9HCG8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CWC22Q9HCG8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CWC22Q9HCG8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CWC22Q9HCG8 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CWC22Q9HCG8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CWC22Q9HCG8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CWC22Q9HCG8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CWC22Q9HCG8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CWC22Q9HCG8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CWC22Q9HCG8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CWC22Q9HCG8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CWC22Q9HCG8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CWC22Q9HCG8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CWC22Q9HCG8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CWC22Q9HCG8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CWC22Q9HCG8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CWC22Q9HCG8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CWC22Q9HCG8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CWC22Q9HCG8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CWC22Q9HCG8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CWC22Q9HCG8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CWC22Q9HCG8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CWC22Q9HCG8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CWC22Q9HCG8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CWC22Q9HCG8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CWC22Q9HCG8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CWC22Q9HCG8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CWC22Q9HCG8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CWC22Q9HCG8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CWC22Q9HCG8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CWC22Q9HCG8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CWC22Q9HCG8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CWC22Q9HCG8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CWC22Q9HCG8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CWC22Q9HCG8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CWC22Q9HCG8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CWC22Q9HCG8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CWC22Q9HCG8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CWC22Q9HCG8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CWC22Q9HCG8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CWC22Q9HCG8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CWC22Q9HCG8 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CWC22Q9HCG8 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CWC22Q9HCG8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CWC22Q9HCG8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CWC22Q9HCG8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CWC22Q9HCG8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CWC22Q9HCG8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CWC22Q9HCG8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CWC22Q9HCG8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CWC22Q9HCG8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CWC22Q9HCG8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CWC22Q9HCG8 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CWC22Q9HCG8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CWC22Q9HCG8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CWC22Q9HCG8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CWC22Q9HCG8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CWC22Q9HCG8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CWC22Q9HCG8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CWC22Q9HCG8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CWC22Q9HCG8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CWC22Q9HCG8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CWC22Q9HCG8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CWC22Q9HCG8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CWC22Q9HCG8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CWC22Q9HCG8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CWC22Q9HCG8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CWC22Q9HCG8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CWC22Q9HCG8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CWC22Q9HCG8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CWC22Q9HCG8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CWC22Q9HCG8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CWC22Q9HCG8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CWC22Q9HCG8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CWC22Q9HCG8 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CWC22Q9HCG8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CWC22Q9HCG8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CWC22Q9HCG8 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CWC22Q9HCG8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CWC22Q9HCG8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CWC22Q9HCG8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CWC22Q9HCG8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CWC22Q9HCG8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CWC22Q9HCG8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms