Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLMPQ9H6B4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLMPQ9H6B4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLMPQ9H6B4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLMPQ9H6B4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLMPQ9H6B4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLMPQ9H6B4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLMPQ9H6B4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CLMPQ9H6B4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLMPQ9H6B4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLMPQ9H6B4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLMPQ9H6B4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLMPQ9H6B4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLMPQ9H6B4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLMPQ9H6B4 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CLMPQ9H6B4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLMPQ9H6B4 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLMPQ9H6B4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CLMPQ9H6B4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLMPQ9H6B4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CLMPQ9H6B4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CLMPQ9H6B4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLMPQ9H6B4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLMPQ9H6B4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLMPQ9H6B4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLMPQ9H6B4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLMPQ9H6B4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLMPQ9H6B4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLMPQ9H6B4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLMPQ9H6B4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CLMPQ9H6B4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CLMPQ9H6B4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLMPQ9H6B4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLMPQ9H6B4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLMPQ9H6B4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLMPQ9H6B4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CLMPQ9H6B4 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLMPQ9H6B4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLMPQ9H6B4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CLMPQ9H6B4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLMPQ9H6B4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLMPQ9H6B4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CLMPQ9H6B4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLMPQ9H6B4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLMPQ9H6B4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLMPQ9H6B4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLMPQ9H6B4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLMPQ9H6B4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLMPQ9H6B4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLMPQ9H6B4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLMPQ9H6B4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLMPQ9H6B4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLMPQ9H6B4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLMPQ9H6B4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLMPQ9H6B4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLMPQ9H6B4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLMPQ9H6B4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLMPQ9H6B4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CLMPQ9H6B4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLMPQ9H6B4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CLMPQ9H6B4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLMPQ9H6B4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLMPQ9H6B4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLMPQ9H6B4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLMPQ9H6B4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLMPQ9H6B4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CLMPQ9H6B4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLMPQ9H6B4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLMPQ9H6B4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLMPQ9H6B4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLMPQ9H6B4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLMPQ9H6B4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLMPQ9H6B4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLMPQ9H6B4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLMPQ9H6B4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLMPQ9H6B4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLMPQ9H6B4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLMPQ9H6B4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLMPQ9H6B4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLMPQ9H6B4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLMPQ9H6B4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CLMPQ9H6B4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLMPQ9H6B4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLMPQ9H6B4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLMPQ9H6B4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLMPQ9H6B4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLMPQ9H6B4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLMPQ9H6B4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLMPQ9H6B4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLMPQ9H6B4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLMPQ9H6B4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLMPQ9H6B4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLMPQ9H6B4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLMPQ9H6B4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLMPQ9H6B4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CLMPQ9H6B4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CLMPQ9H6B4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLMPQ9H6B4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLMPQ9H6B4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLMPQ9H6B4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 293 ms