Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K1

SLC39A8, Zinc transporter ZIP8, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A8Q9C0K1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC39A8Q9C0K1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC39A8Q9C0K1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC39A8Q9C0K1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC39A8Q9C0K1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC39A8Q9C0K1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC39A8Q9C0K1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC39A8Q9C0K1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC39A8Q9C0K1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC39A8Q9C0K1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC39A8Q9C0K1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC39A8Q9C0K1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC39A8Q9C0K1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC39A8Q9C0K1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC39A8Q9C0K1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC39A8Q9C0K1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC39A8Q9C0K1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC39A8Q9C0K1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC39A8Q9C0K1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC39A8Q9C0K1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC39A8Q9C0K1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC39A8Q9C0K1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC39A8Q9C0K1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC39A8Q9C0K1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC39A8Q9C0K1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC39A8Q9C0K1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC39A8Q9C0K1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC39A8Q9C0K1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC39A8Q9C0K1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC39A8Q9C0K1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC39A8Q9C0K1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC39A8Q9C0K1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC39A8Q9C0K1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC39A8Q9C0K1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC39A8Q9C0K1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC39A8Q9C0K1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC39A8Q9C0K1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC39A8Q9C0K1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC39A8Q9C0K1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC39A8Q9C0K1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC39A8Q9C0K1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC39A8Q9C0K1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC39A8Q9C0K1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC39A8Q9C0K1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC39A8Q9C0K1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC39A8Q9C0K1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC39A8Q9C0K1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC39A8Q9C0K1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC39A8Q9C0K1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC39A8Q9C0K1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC39A8Q9C0K1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC39A8Q9C0K1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC39A8Q9C0K1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC39A8Q9C0K1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC39A8Q9C0K1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC39A8Q9C0K1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC39A8Q9C0K1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC39A8Q9C0K1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC39A8Q9C0K1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC39A8Q9C0K1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC39A8Q9C0K1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC39A8Q9C0K1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC39A8Q9C0K1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC39A8Q9C0K1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC39A8Q9C0K1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC39A8Q9C0K1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC39A8Q9C0K1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC39A8Q9C0K1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC39A8Q9C0K1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC39A8Q9C0K1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC39A8Q9C0K1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC39A8Q9C0K1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC39A8Q9C0K1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC39A8Q9C0K1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC39A8Q9C0K1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC39A8Q9C0K1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC39A8Q9C0K1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC39A8Q9C0K1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC39A8Q9C0K1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC39A8Q9C0K1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC39A8Q9C0K1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC39A8Q9C0K1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC39A8Q9C0K1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC39A8Q9C0K1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC39A8Q9C0K1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC39A8Q9C0K1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC39A8Q9C0K1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC39A8Q9C0K1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC39A8Q9C0K1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC39A8Q9C0K1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC39A8Q9C0K1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC39A8Q9C0K1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC39A8Q9C0K1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC39A8Q9C0K1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC39A8Q9C0K1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC39A8Q9C0K1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC39A8Q9C0K1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC39A8Q9C0K1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC39A8Q9C0K1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC39A8Q9C0K1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms