Protein–RNA interactions for Protein: Q9C030

TRIM6, Tripartite motif-containing protein 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM6Q9C030 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM6Q9C030 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM6Q9C030 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM6Q9C030 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM6Q9C030 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM6Q9C030 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM6Q9C030 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM6Q9C030 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM6Q9C030 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM6Q9C030 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM6Q9C030 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM6Q9C030 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM6Q9C030 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM6Q9C030 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM6Q9C030 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM6Q9C030 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM6Q9C030 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM6Q9C030 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM6Q9C030 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM6Q9C030 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM6Q9C030 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM6Q9C030 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM6Q9C030 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM6Q9C030 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM6Q9C030 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM6Q9C030 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM6Q9C030 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM6Q9C030 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM6Q9C030 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM6Q9C030 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM6Q9C030 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM6Q9C030 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM6Q9C030 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM6Q9C030 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM6Q9C030 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM6Q9C030 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM6Q9C030 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM6Q9C030 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM6Q9C030 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM6Q9C030 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM6Q9C030 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM6Q9C030 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM6Q9C030 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM6Q9C030 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM6Q9C030 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM6Q9C030 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM6Q9C030 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM6Q9C030 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM6Q9C030 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM6Q9C030 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM6Q9C030 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM6Q9C030 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM6Q9C030 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM6Q9C030 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM6Q9C030 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM6Q9C030 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM6Q9C030 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM6Q9C030 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM6Q9C030 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM6Q9C030 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM6Q9C030 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM6Q9C030 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM6Q9C030 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM6Q9C030 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM6Q9C030 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM6Q9C030 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM6Q9C030 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM6Q9C030 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM6Q9C030 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM6Q9C030 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM6Q9C030 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM6Q9C030 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM6Q9C030 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM6Q9C030 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM6Q9C030 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM6Q9C030 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM6Q9C030 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM6Q9C030 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM6Q9C030 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM6Q9C030 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM6Q9C030 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM6Q9C030 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM6Q9C030 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM6Q9C030 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM6Q9C030 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM6Q9C030 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM6Q9C030 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM6Q9C030 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM6Q9C030 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM6Q9C030 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM6Q9C030 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM6Q9C030 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM6Q9C030 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM6Q9C030 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM6Q9C030 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM6Q9C030 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM6Q9C030 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM6Q9C030 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM6Q9C030 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM6Q9C030 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms