Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXQ1Q9C009 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXQ1Q9C009 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXQ1Q9C009 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXQ1Q9C009 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXQ1Q9C009 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXQ1Q9C009 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXQ1Q9C009 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXQ1Q9C009 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXQ1Q9C009 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXQ1Q9C009 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXQ1Q9C009 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXQ1Q9C009 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXQ1Q9C009 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXQ1Q9C009 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXQ1Q9C009 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXQ1Q9C009 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXQ1Q9C009 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXQ1Q9C009 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXQ1Q9C009 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXQ1Q9C009 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FOXQ1Q9C009 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FOXQ1Q9C009 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FOXQ1Q9C009 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXQ1Q9C009 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXQ1Q9C009 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXQ1Q9C009 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXQ1Q9C009 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXQ1Q9C009 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXQ1Q9C009 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXQ1Q9C009 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXQ1Q9C009 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXQ1Q9C009 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXQ1Q9C009 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXQ1Q9C009 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXQ1Q9C009 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXQ1Q9C009 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXQ1Q9C009 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXQ1Q9C009 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXQ1Q9C009 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXQ1Q9C009 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXQ1Q9C009 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXQ1Q9C009 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXQ1Q9C009 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXQ1Q9C009 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXQ1Q9C009 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXQ1Q9C009 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXQ1Q9C009 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXQ1Q9C009 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXQ1Q9C009 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXQ1Q9C009 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXQ1Q9C009 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXQ1Q9C009 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXQ1Q9C009 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXQ1Q9C009 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXQ1Q9C009 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXQ1Q9C009 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXQ1Q9C009 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXQ1Q9C009 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXQ1Q9C009 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXQ1Q9C009 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXQ1Q9C009 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXQ1Q9C009 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXQ1Q9C009 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXQ1Q9C009 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXQ1Q9C009 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXQ1Q9C009 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXQ1Q9C009 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXQ1Q9C009 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXQ1Q9C009 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXQ1Q9C009 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXQ1Q9C009 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXQ1Q9C009 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXQ1Q9C009 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXQ1Q9C009 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXQ1Q9C009 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXQ1Q9C009 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXQ1Q9C009 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXQ1Q9C009 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXQ1Q9C009 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXQ1Q9C009 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXQ1Q9C009 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXQ1Q9C009 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXQ1Q9C009 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
FOXQ1Q9C009 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
FOXQ1Q9C009 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXQ1Q9C009 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXQ1Q9C009 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXQ1Q9C009 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXQ1Q9C009 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXQ1Q9C009 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXQ1Q9C009 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXQ1Q9C009 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXQ1Q9C009 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXQ1Q9C009 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXQ1Q9C009 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXQ1Q9C009 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXQ1Q9C009 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXQ1Q9C009 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXQ1Q9C009 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
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