Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ROPN1BQ9BZX4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ROPN1BQ9BZX4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ROPN1BQ9BZX4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ROPN1BQ9BZX4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ROPN1BQ9BZX4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ROPN1BQ9BZX4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ROPN1BQ9BZX4 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ROPN1BQ9BZX4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ROPN1BQ9BZX4 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ROPN1BQ9BZX4 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ROPN1BQ9BZX4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ROPN1BQ9BZX4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ROPN1BQ9BZX4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ROPN1BQ9BZX4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ROPN1BQ9BZX4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ROPN1BQ9BZX4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ROPN1BQ9BZX4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ROPN1BQ9BZX4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ROPN1BQ9BZX4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ROPN1BQ9BZX4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ROPN1BQ9BZX4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ROPN1BQ9BZX4 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ROPN1BQ9BZX4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ROPN1BQ9BZX4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ROPN1BQ9BZX4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ROPN1BQ9BZX4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ROPN1BQ9BZX4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ROPN1BQ9BZX4 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ROPN1BQ9BZX4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ROPN1BQ9BZX4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ROPN1BQ9BZX4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ROPN1BQ9BZX4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ROPN1BQ9BZX4 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ROPN1BQ9BZX4 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ROPN1BQ9BZX4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ROPN1BQ9BZX4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ROPN1BQ9BZX4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ROPN1BQ9BZX4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ROPN1BQ9BZX4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ROPN1BQ9BZX4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ROPN1BQ9BZX4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ROPN1BQ9BZX4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ROPN1BQ9BZX4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ROPN1BQ9BZX4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ROPN1BQ9BZX4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ROPN1BQ9BZX4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ROPN1BQ9BZX4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ROPN1BQ9BZX4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ROPN1BQ9BZX4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ROPN1BQ9BZX4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ROPN1BQ9BZX4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ROPN1BQ9BZX4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ROPN1BQ9BZX4 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ROPN1BQ9BZX4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ROPN1BQ9BZX4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ROPN1BQ9BZX4 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ROPN1BQ9BZX4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ROPN1BQ9BZX4 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ROPN1BQ9BZX4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ROPN1BQ9BZX4 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ROPN1BQ9BZX4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ROPN1BQ9BZX4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ROPN1BQ9BZX4 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ROPN1BQ9BZX4 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ROPN1BQ9BZX4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ROPN1BQ9BZX4 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ROPN1BQ9BZX4 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ROPN1BQ9BZX4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ROPN1BQ9BZX4 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ROPN1BQ9BZX4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ROPN1BQ9BZX4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ROPN1BQ9BZX4 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ROPN1BQ9BZX4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ROPN1BQ9BZX4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ROPN1BQ9BZX4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ROPN1BQ9BZX4 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ROPN1BQ9BZX4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ROPN1BQ9BZX4 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ROPN1BQ9BZX4 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ROPN1BQ9BZX4 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ROPN1BQ9BZX4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ROPN1BQ9BZX4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ROPN1BQ9BZX4 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ROPN1BQ9BZX4 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ROPN1BQ9BZX4 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ROPN1BQ9BZX4 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ROPN1BQ9BZX4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ROPN1BQ9BZX4 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ROPN1BQ9BZX4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ROPN1BQ9BZX4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ROPN1BQ9BZX4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ROPN1BQ9BZX4 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ROPN1BQ9BZX4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ROPN1BQ9BZX4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ROPN1BQ9BZX4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ROPN1BQ9BZX4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ROPN1BQ9BZX4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ROPN1BQ9BZX4 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ROPN1BQ9BZX4 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms