Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ7

RTP3, Receptor-transporting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP3Q9BQQ7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RTP3Q9BQQ7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RTP3Q9BQQ7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RTP3Q9BQQ7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RTP3Q9BQQ7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RTP3Q9BQQ7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RTP3Q9BQQ7 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RTP3Q9BQQ7 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RTP3Q9BQQ7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RTP3Q9BQQ7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RTP3Q9BQQ7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RTP3Q9BQQ7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RTP3Q9BQQ7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RTP3Q9BQQ7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RTP3Q9BQQ7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RTP3Q9BQQ7 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RTP3Q9BQQ7 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RTP3Q9BQQ7 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RTP3Q9BQQ7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RTP3Q9BQQ7 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RTP3Q9BQQ7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RTP3Q9BQQ7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RTP3Q9BQQ7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RTP3Q9BQQ7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RTP3Q9BQQ7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RTP3Q9BQQ7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RTP3Q9BQQ7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RTP3Q9BQQ7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RTP3Q9BQQ7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RTP3Q9BQQ7 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RTP3Q9BQQ7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RTP3Q9BQQ7 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RTP3Q9BQQ7 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RTP3Q9BQQ7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RTP3Q9BQQ7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RTP3Q9BQQ7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RTP3Q9BQQ7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RTP3Q9BQQ7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RTP3Q9BQQ7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RTP3Q9BQQ7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RTP3Q9BQQ7 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RTP3Q9BQQ7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RTP3Q9BQQ7 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RTP3Q9BQQ7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RTP3Q9BQQ7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RTP3Q9BQQ7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RTP3Q9BQQ7 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RTP3Q9BQQ7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RTP3Q9BQQ7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RTP3Q9BQQ7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RTP3Q9BQQ7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RTP3Q9BQQ7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RTP3Q9BQQ7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RTP3Q9BQQ7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RTP3Q9BQQ7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RTP3Q9BQQ7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RTP3Q9BQQ7 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RTP3Q9BQQ7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RTP3Q9BQQ7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RTP3Q9BQQ7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RTP3Q9BQQ7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RTP3Q9BQQ7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RTP3Q9BQQ7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RTP3Q9BQQ7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RTP3Q9BQQ7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTP3Q9BQQ7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTP3Q9BQQ7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTP3Q9BQQ7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTP3Q9BQQ7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTP3Q9BQQ7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTP3Q9BQQ7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTP3Q9BQQ7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTP3Q9BQQ7 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTP3Q9BQQ7 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RTP3Q9BQQ7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTP3Q9BQQ7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTP3Q9BQQ7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTP3Q9BQQ7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTP3Q9BQQ7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTP3Q9BQQ7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTP3Q9BQQ7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTP3Q9BQQ7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTP3Q9BQQ7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTP3Q9BQQ7 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTP3Q9BQQ7 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTP3Q9BQQ7 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTP3Q9BQQ7 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RTP3Q9BQQ7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTP3Q9BQQ7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTP3Q9BQQ7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTP3Q9BQQ7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTP3Q9BQQ7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTP3Q9BQQ7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTP3Q9BQQ7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTP3Q9BQQ7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTP3Q9BQQ7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RTP3Q9BQQ7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RTP3Q9BQQ7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RTP3Q9BQQ7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RTP3Q9BQQ7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90 ms