Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC13□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC13□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms