Protein–RNA interactions for Protein: Q99966

CITED1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1Q99966 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CITED1Q99966 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CITED1Q99966 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CITED1Q99966 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CITED1Q99966 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CITED1Q99966 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CITED1Q99966 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CITED1Q99966 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CITED1Q99966 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CITED1Q99966 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CITED1Q99966 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CITED1Q99966 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CITED1Q99966 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CITED1Q99966 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CITED1Q99966 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CITED1Q99966 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CITED1Q99966 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CITED1Q99966 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CITED1Q99966 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CITED1Q99966 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CITED1Q99966 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CITED1Q99966 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CITED1Q99966 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CITED1Q99966 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CITED1Q99966 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CITED1Q99966 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CITED1Q99966 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CITED1Q99966 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CITED1Q99966 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CITED1Q99966 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CITED1Q99966 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CITED1Q99966 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CITED1Q99966 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CITED1Q99966 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CITED1Q99966 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CITED1Q99966 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CITED1Q99966 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CITED1Q99966 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CITED1Q99966 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CITED1Q99966 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CITED1Q99966 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CITED1Q99966 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CITED1Q99966 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CITED1Q99966 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CITED1Q99966 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CITED1Q99966 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CITED1Q99966 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CITED1Q99966 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CITED1Q99966 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CITED1Q99966 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CITED1Q99966 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CITED1Q99966 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CITED1Q99966 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CITED1Q99966 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CITED1Q99966 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CITED1Q99966 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CITED1Q99966 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CITED1Q99966 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CITED1Q99966 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CITED1Q99966 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CITED1Q99966 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CITED1Q99966 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CITED1Q99966 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CITED1Q99966 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CITED1Q99966 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CITED1Q99966 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CITED1Q99966 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CITED1Q99966 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CITED1Q99966 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CITED1Q99966 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CITED1Q99966 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CITED1Q99966 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CITED1Q99966 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CITED1Q99966 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CITED1Q99966 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CITED1Q99966 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CITED1Q99966 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CITED1Q99966 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CITED1Q99966 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CITED1Q99966 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CITED1Q99966 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CITED1Q99966 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CITED1Q99966 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CITED1Q99966 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CITED1Q99966 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CITED1Q99966 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CITED1Q99966 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CITED1Q99966 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CITED1Q99966 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CITED1Q99966 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CITED1Q99966 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CITED1Q99966 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CITED1Q99966 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CITED1Q99966 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CITED1Q99966 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CITED1Q99966 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CITED1Q99966 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CITED1Q99966 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CITED1Q99966 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CITED1Q99966 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms