Protein–RNA interactions for Protein: Q99952

PTPN18, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 18, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN18Q99952 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPN18Q99952 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPN18Q99952 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPN18Q99952 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPN18Q99952 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPN18Q99952 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPN18Q99952 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPN18Q99952 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPN18Q99952 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPN18Q99952 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPN18Q99952 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPN18Q99952 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPN18Q99952 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPN18Q99952 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPN18Q99952 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPN18Q99952 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPN18Q99952 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPN18Q99952 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPN18Q99952 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPN18Q99952 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPN18Q99952 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPN18Q99952 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPN18Q99952 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPN18Q99952 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPN18Q99952 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPN18Q99952 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPN18Q99952 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPN18Q99952 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPN18Q99952 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPN18Q99952 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPN18Q99952 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPN18Q99952 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPN18Q99952 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPN18Q99952 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPN18Q99952 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPN18Q99952 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPN18Q99952 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPN18Q99952 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPN18Q99952 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPN18Q99952 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPN18Q99952 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPN18Q99952 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPN18Q99952 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPN18Q99952 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPN18Q99952 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPN18Q99952 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPN18Q99952 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPN18Q99952 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPN18Q99952 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPN18Q99952 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPN18Q99952 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPN18Q99952 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPN18Q99952 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPN18Q99952 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPN18Q99952 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPN18Q99952 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPN18Q99952 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPN18Q99952 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPN18Q99952 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPN18Q99952 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPN18Q99952 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPN18Q99952 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPN18Q99952 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPN18Q99952 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPN18Q99952 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPN18Q99952 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPN18Q99952 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPN18Q99952 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPN18Q99952 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPN18Q99952 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPN18Q99952 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPN18Q99952 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPN18Q99952 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPN18Q99952 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPN18Q99952 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPN18Q99952 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPN18Q99952 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPN18Q99952 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPN18Q99952 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPN18Q99952 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPN18Q99952 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPN18Q99952 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPN18Q99952 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPN18Q99952 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPN18Q99952 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPN18Q99952 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPN18Q99952 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPN18Q99952 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPN18Q99952 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPN18Q99952 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPN18Q99952 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PTPN18Q99952 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PTPN18Q99952 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PTPN18Q99952 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPN18Q99952 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPN18Q99952 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPN18Q99952 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPN18Q99952 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPN18Q99952 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPN18Q99952 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms