Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PITX2Q99697 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PITX2Q99697 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PITX2Q99697 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PITX2Q99697 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PITX2Q99697 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PITX2Q99697 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PITX2Q99697 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PITX2Q99697 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PITX2Q99697 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PITX2Q99697 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PITX2Q99697 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PITX2Q99697 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PITX2Q99697 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PITX2Q99697 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PITX2Q99697 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PITX2Q99697 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PITX2Q99697 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PITX2Q99697 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PITX2Q99697 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PITX2Q99697 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PITX2Q99697 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PITX2Q99697 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PITX2Q99697 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PITX2Q99697 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PITX2Q99697 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PITX2Q99697 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PITX2Q99697 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PITX2Q99697 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PITX2Q99697 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PITX2Q99697 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PITX2Q99697 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PITX2Q99697 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PITX2Q99697 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PITX2Q99697 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PITX2Q99697 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PITX2Q99697 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PITX2Q99697 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PITX2Q99697 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PITX2Q99697 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PITX2Q99697 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PITX2Q99697 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PITX2Q99697 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PITX2Q99697 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PITX2Q99697 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PITX2Q99697 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PITX2Q99697 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PITX2Q99697 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PITX2Q99697 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PITX2Q99697 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PITX2Q99697 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PITX2Q99697 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PITX2Q99697 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PITX2Q99697 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PITX2Q99697 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PITX2Q99697 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PITX2Q99697 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PITX2Q99697 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PITX2Q99697 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PITX2Q99697 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PITX2Q99697 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PITX2Q99697 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PITX2Q99697 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PITX2Q99697 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PITX2Q99697 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PITX2Q99697 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PITX2Q99697 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PITX2Q99697 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PITX2Q99697 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PITX2Q99697 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PITX2Q99697 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PITX2Q99697 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PITX2Q99697 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PITX2Q99697 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PITX2Q99697 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PITX2Q99697 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PITX2Q99697 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PITX2Q99697 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PITX2Q99697 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PITX2Q99697 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PITX2Q99697 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PITX2Q99697 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PITX2Q99697 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PITX2Q99697 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PITX2Q99697 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PITX2Q99697 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PITX2Q99697 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PITX2Q99697 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PITX2Q99697 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PITX2Q99697 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PITX2Q99697 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PITX2Q99697 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PITX2Q99697 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PITX2Q99697 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PITX2Q99697 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PITX2Q99697 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PITX2Q99697 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PITX2Q99697 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PITX2Q99697 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PITX2Q99697 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms