Protein–RNA interactions for Protein: Q99551

MTERF1, Transcription termination factor 1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF1Q99551 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MTERF1Q99551 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MTERF1Q99551 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MTERF1Q99551 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MTERF1Q99551 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MTERF1Q99551 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MTERF1Q99551 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MTERF1Q99551 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MTERF1Q99551 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MTERF1Q99551 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MTERF1Q99551 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MTERF1Q99551 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MTERF1Q99551 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MTERF1Q99551 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MTERF1Q99551 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MTERF1Q99551 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MTERF1Q99551 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MTERF1Q99551 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MTERF1Q99551 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MTERF1Q99551 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MTERF1Q99551 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MTERF1Q99551 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
MTERF1Q99551 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MTERF1Q99551 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MTERF1Q99551 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MTERF1Q99551 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
MTERF1Q99551 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MTERF1Q99551 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MTERF1Q99551 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MTERF1Q99551 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MTERF1Q99551 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MTERF1Q99551 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MTERF1Q99551 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MTERF1Q99551 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MTERF1Q99551 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MTERF1Q99551 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MTERF1Q99551 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MTERF1Q99551 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MTERF1Q99551 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MTERF1Q99551 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
MTERF1Q99551 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MTERF1Q99551 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
MTERF1Q99551 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTERF1Q99551 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTERF1Q99551 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTERF1Q99551 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTERF1Q99551 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTERF1Q99551 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTERF1Q99551 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTERF1Q99551 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTERF1Q99551 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MTERF1Q99551 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTERF1Q99551 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTERF1Q99551 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTERF1Q99551 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTERF1Q99551 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTERF1Q99551 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTERF1Q99551 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTERF1Q99551 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTERF1Q99551 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTERF1Q99551 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTERF1Q99551 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTERF1Q99551 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTERF1Q99551 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MTERF1Q99551 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTERF1Q99551 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTERF1Q99551 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTERF1Q99551 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTERF1Q99551 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTERF1Q99551 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTERF1Q99551 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTERF1Q99551 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTERF1Q99551 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTERF1Q99551 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
MTERF1Q99551 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTERF1Q99551 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTERF1Q99551 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTERF1Q99551 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
MTERF1Q99551 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTERF1Q99551 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTERF1Q99551 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTERF1Q99551 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTERF1Q99551 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTERF1Q99551 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
MTERF1Q99551 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTERF1Q99551 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTERF1Q99551 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTERF1Q99551 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTERF1Q99551 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTERF1Q99551 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTERF1Q99551 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTERF1Q99551 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTERF1Q99551 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTERF1Q99551 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTERF1Q99551 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTERF1Q99551 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTERF1Q99551 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTERF1Q99551 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTERF1Q99551 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTERF1Q99551 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms