Protein–RNA interactions for Protein: Q96T51

RUFY1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY1Q96T51 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RUFY1Q96T51 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RUFY1Q96T51 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RUFY1Q96T51 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RUFY1Q96T51 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RUFY1Q96T51 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RUFY1Q96T51 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RUFY1Q96T51 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RUFY1Q96T51 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RUFY1Q96T51 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RUFY1Q96T51 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RUFY1Q96T51 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RUFY1Q96T51 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RUFY1Q96T51 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RUFY1Q96T51 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RUFY1Q96T51 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RUFY1Q96T51 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RUFY1Q96T51 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RUFY1Q96T51 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RUFY1Q96T51 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RUFY1Q96T51 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RUFY1Q96T51 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RUFY1Q96T51 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RUFY1Q96T51 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RUFY1Q96T51 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RUFY1Q96T51 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RUFY1Q96T51 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RUFY1Q96T51 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RUFY1Q96T51 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RUFY1Q96T51 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RUFY1Q96T51 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RUFY1Q96T51 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RUFY1Q96T51 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RUFY1Q96T51 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RUFY1Q96T51 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RUFY1Q96T51 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RUFY1Q96T51 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RUFY1Q96T51 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RUFY1Q96T51 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RUFY1Q96T51 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUFY1Q96T51 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUFY1Q96T51 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUFY1Q96T51 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUFY1Q96T51 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUFY1Q96T51 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUFY1Q96T51 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUFY1Q96T51 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUFY1Q96T51 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUFY1Q96T51 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUFY1Q96T51 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUFY1Q96T51 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUFY1Q96T51 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RUFY1Q96T51 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUFY1Q96T51 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RUFY1Q96T51 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RUFY1Q96T51 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RUFY1Q96T51 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RUFY1Q96T51 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RUFY1Q96T51 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RUFY1Q96T51 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RUFY1Q96T51 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RUFY1Q96T51 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RUFY1Q96T51 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RUFY1Q96T51 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RUFY1Q96T51 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RUFY1Q96T51 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RUFY1Q96T51 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RUFY1Q96T51 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RUFY1Q96T51 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RUFY1Q96T51 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RUFY1Q96T51 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RUFY1Q96T51 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RUFY1Q96T51 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RUFY1Q96T51 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RUFY1Q96T51 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RUFY1Q96T51 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RUFY1Q96T51 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RUFY1Q96T51 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RUFY1Q96T51 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RUFY1Q96T51 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RUFY1Q96T51 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RUFY1Q96T51 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RUFY1Q96T51 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RUFY1Q96T51 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RUFY1Q96T51 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RUFY1Q96T51 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RUFY1Q96T51 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RUFY1Q96T51 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RUFY1Q96T51 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RUFY1Q96T51 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RUFY1Q96T51 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RUFY1Q96T51 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUFY1Q96T51 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUFY1Q96T51 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUFY1Q96T51 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUFY1Q96T51 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUFY1Q96T51 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUFY1Q96T51 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUFY1Q96T51 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUFY1Q96T51 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms