Protein–RNA interactions for Protein: Q96SM3

CPXM1, Probable carboxypeptidase X1, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPXM1Q96SM3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPXM1Q96SM3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPXM1Q96SM3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPXM1Q96SM3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPXM1Q96SM3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPXM1Q96SM3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPXM1Q96SM3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPXM1Q96SM3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPXM1Q96SM3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPXM1Q96SM3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPXM1Q96SM3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPXM1Q96SM3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPXM1Q96SM3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPXM1Q96SM3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPXM1Q96SM3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPXM1Q96SM3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPXM1Q96SM3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPXM1Q96SM3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CPXM1Q96SM3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPXM1Q96SM3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPXM1Q96SM3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CPXM1Q96SM3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPXM1Q96SM3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPXM1Q96SM3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPXM1Q96SM3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPXM1Q96SM3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CPXM1Q96SM3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPXM1Q96SM3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPXM1Q96SM3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPXM1Q96SM3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPXM1Q96SM3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPXM1Q96SM3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPXM1Q96SM3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CPXM1Q96SM3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CPXM1Q96SM3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPXM1Q96SM3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPXM1Q96SM3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPXM1Q96SM3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CPXM1Q96SM3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CPXM1Q96SM3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CPXM1Q96SM3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CPXM1Q96SM3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CPXM1Q96SM3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CPXM1Q96SM3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CPXM1Q96SM3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CPXM1Q96SM3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CPXM1Q96SM3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CPXM1Q96SM3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CPXM1Q96SM3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CPXM1Q96SM3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CPXM1Q96SM3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CPXM1Q96SM3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CPXM1Q96SM3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
CPXM1Q96SM3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPXM1Q96SM3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPXM1Q96SM3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CPXM1Q96SM3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPXM1Q96SM3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPXM1Q96SM3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPXM1Q96SM3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPXM1Q96SM3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPXM1Q96SM3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPXM1Q96SM3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPXM1Q96SM3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPXM1Q96SM3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPXM1Q96SM3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPXM1Q96SM3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPXM1Q96SM3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPXM1Q96SM3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPXM1Q96SM3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPXM1Q96SM3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPXM1Q96SM3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPXM1Q96SM3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPXM1Q96SM3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPXM1Q96SM3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPXM1Q96SM3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPXM1Q96SM3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPXM1Q96SM3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPXM1Q96SM3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPXM1Q96SM3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPXM1Q96SM3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPXM1Q96SM3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPXM1Q96SM3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPXM1Q96SM3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPXM1Q96SM3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPXM1Q96SM3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPXM1Q96SM3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPXM1Q96SM3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPXM1Q96SM3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPXM1Q96SM3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CPXM1Q96SM3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPXM1Q96SM3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPXM1Q96SM3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPXM1Q96SM3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPXM1Q96SM3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPXM1Q96SM3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPXM1Q96SM3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPXM1Q96SM3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPXM1Q96SM3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPXM1Q96SM3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms