Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GCNAQ96QF7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GCNAQ96QF7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GCNAQ96QF7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GCNAQ96QF7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GCNAQ96QF7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GCNAQ96QF7 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GCNAQ96QF7 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GCNAQ96QF7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GCNAQ96QF7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GCNAQ96QF7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GCNAQ96QF7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GCNAQ96QF7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GCNAQ96QF7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GCNAQ96QF7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GCNAQ96QF7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GCNAQ96QF7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GCNAQ96QF7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GCNAQ96QF7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GCNAQ96QF7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GCNAQ96QF7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GCNAQ96QF7 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GCNAQ96QF7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GCNAQ96QF7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GCNAQ96QF7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GCNAQ96QF7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GCNAQ96QF7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GCNAQ96QF7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GCNAQ96QF7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GCNAQ96QF7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GCNAQ96QF7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GCNAQ96QF7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GCNAQ96QF7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GCNAQ96QF7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GCNAQ96QF7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GCNAQ96QF7 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GCNAQ96QF7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GCNAQ96QF7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GCNAQ96QF7 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GCNAQ96QF7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GCNAQ96QF7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GCNAQ96QF7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GCNAQ96QF7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GCNAQ96QF7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GCNAQ96QF7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GCNAQ96QF7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GCNAQ96QF7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GCNAQ96QF7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GCNAQ96QF7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GCNAQ96QF7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GCNAQ96QF7 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GCNAQ96QF7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GCNAQ96QF7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GCNAQ96QF7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GCNAQ96QF7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GCNAQ96QF7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GCNAQ96QF7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GCNAQ96QF7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GCNAQ96QF7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GCNAQ96QF7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GCNAQ96QF7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GCNAQ96QF7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GCNAQ96QF7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GCNAQ96QF7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GCNAQ96QF7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GCNAQ96QF7 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GCNAQ96QF7 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GCNAQ96QF7 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GCNAQ96QF7 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GCNAQ96QF7 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GCNAQ96QF7 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GCNAQ96QF7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GCNAQ96QF7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GCNAQ96QF7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GCNAQ96QF7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GCNAQ96QF7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GCNAQ96QF7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GCNAQ96QF7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GCNAQ96QF7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GCNAQ96QF7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GCNAQ96QF7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GCNAQ96QF7 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GCNAQ96QF7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GCNAQ96QF7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GCNAQ96QF7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GCNAQ96QF7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GCNAQ96QF7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GCNAQ96QF7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GCNAQ96QF7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GCNAQ96QF7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GCNAQ96QF7 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GCNAQ96QF7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GCNAQ96QF7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GCNAQ96QF7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GCNAQ96QF7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GCNAQ96QF7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GCNAQ96QF7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GCNAQ96QF7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GCNAQ96QF7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GCNAQ96QF7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms