Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMG1Q96Q15 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMG1Q96Q15 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMG1Q96Q15 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SMG1Q96Q15 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SMG1Q96Q15 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
SMG1Q96Q15 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SMG1Q96Q15 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMG1Q96Q15 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMG1Q96Q15 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMG1Q96Q15 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMG1Q96Q15 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMG1Q96Q15 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMG1Q96Q15 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMG1Q96Q15 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMG1Q96Q15 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMG1Q96Q15 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMG1Q96Q15 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMG1Q96Q15 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMG1Q96Q15 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMG1Q96Q15 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMG1Q96Q15 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMG1Q96Q15 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMG1Q96Q15 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMG1Q96Q15 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMG1Q96Q15 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMG1Q96Q15 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMG1Q96Q15 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMG1Q96Q15 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMG1Q96Q15 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMG1Q96Q15 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMG1Q96Q15 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMG1Q96Q15 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMG1Q96Q15 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMG1Q96Q15 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMG1Q96Q15 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMG1Q96Q15 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMG1Q96Q15 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMG1Q96Q15 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SMG1Q96Q15 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMG1Q96Q15 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMG1Q96Q15 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMG1Q96Q15 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMG1Q96Q15 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMG1Q96Q15 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMG1Q96Q15 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMG1Q96Q15 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMG1Q96Q15 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMG1Q96Q15 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMG1Q96Q15 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMG1Q96Q15 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMG1Q96Q15 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMG1Q96Q15 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SMG1Q96Q15 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMG1Q96Q15 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMG1Q96Q15 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SMG1Q96Q15 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMG1Q96Q15 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMG1Q96Q15 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMG1Q96Q15 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMG1Q96Q15 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMG1Q96Q15 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMG1Q96Q15 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMG1Q96Q15 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMG1Q96Q15 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMG1Q96Q15 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMG1Q96Q15 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SMG1Q96Q15 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SMG1Q96Q15 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SMG1Q96Q15 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SMG1Q96Q15 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SMG1Q96Q15 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SMG1Q96Q15 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SMG1Q96Q15 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SMG1Q96Q15 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SMG1Q96Q15 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
SMG1Q96Q15 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
SMG1Q96Q15 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
SMG1Q96Q15 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SMG1Q96Q15 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
SMG1Q96Q15 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMG1Q96Q15 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMG1Q96Q15 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMG1Q96Q15 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMG1Q96Q15 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMG1Q96Q15 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMG1Q96Q15 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SMG1Q96Q15 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMG1Q96Q15 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMG1Q96Q15 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMG1Q96Q15 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMG1Q96Q15 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMG1Q96Q15 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMG1Q96Q15 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMG1Q96Q15 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMG1Q96Q15 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMG1Q96Q15 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMG1Q96Q15 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMG1Q96Q15 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMG1Q96Q15 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
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