Protein–RNA interactions for Protein: Q96M94

KLHL15, Kelch-like protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL15Q96M94 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL15Q96M94 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL15Q96M94 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL15Q96M94 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL15Q96M94 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL15Q96M94 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL15Q96M94 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL15Q96M94 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL15Q96M94 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL15Q96M94 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL15Q96M94 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL15Q96M94 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL15Q96M94 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL15Q96M94 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL15Q96M94 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL15Q96M94 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL15Q96M94 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL15Q96M94 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL15Q96M94 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL15Q96M94 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL15Q96M94 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL15Q96M94 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL15Q96M94 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL15Q96M94 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL15Q96M94 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL15Q96M94 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL15Q96M94 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL15Q96M94 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL15Q96M94 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL15Q96M94 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL15Q96M94 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL15Q96M94 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL15Q96M94 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL15Q96M94 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL15Q96M94 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL15Q96M94 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL15Q96M94 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL15Q96M94 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL15Q96M94 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL15Q96M94 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL15Q96M94 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL15Q96M94 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL15Q96M94 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL15Q96M94 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL15Q96M94 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL15Q96M94 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL15Q96M94 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL15Q96M94 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL15Q96M94 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL15Q96M94 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL15Q96M94 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL15Q96M94 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL15Q96M94 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL15Q96M94 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL15Q96M94 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL15Q96M94 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL15Q96M94 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL15Q96M94 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL15Q96M94 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL15Q96M94 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL15Q96M94 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL15Q96M94 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL15Q96M94 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL15Q96M94 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL15Q96M94 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL15Q96M94 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL15Q96M94 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL15Q96M94 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL15Q96M94 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL15Q96M94 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL15Q96M94 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL15Q96M94 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL15Q96M94 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL15Q96M94 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL15Q96M94 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL15Q96M94 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL15Q96M94 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL15Q96M94 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL15Q96M94 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL15Q96M94 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL15Q96M94 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL15Q96M94 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL15Q96M94 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL15Q96M94 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL15Q96M94 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL15Q96M94 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL15Q96M94 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL15Q96M94 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL15Q96M94 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL15Q96M94 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL15Q96M94 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL15Q96M94 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL15Q96M94 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL15Q96M94 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL15Q96M94 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL15Q96M94 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL15Q96M94 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL15Q96M94 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL15Q96M94 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL15Q96M94 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms