Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms