Protein–RNA interactions for Protein: Q96KA5

CLPTM1L, Cleft lip and palate transmembrane protein 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPTM1LQ96KA5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLPTM1LQ96KA5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CLPTM1LQ96KA5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLPTM1LQ96KA5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLPTM1LQ96KA5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLPTM1LQ96KA5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLPTM1LQ96KA5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLPTM1LQ96KA5 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLPTM1LQ96KA5 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLPTM1LQ96KA5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLPTM1LQ96KA5 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLPTM1LQ96KA5 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLPTM1LQ96KA5 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLPTM1LQ96KA5 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLPTM1LQ96KA5 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLPTM1LQ96KA5 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLPTM1LQ96KA5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLPTM1LQ96KA5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CLPTM1LQ96KA5 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLPTM1LQ96KA5 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLPTM1LQ96KA5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLPTM1LQ96KA5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLPTM1LQ96KA5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLPTM1LQ96KA5 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLPTM1LQ96KA5 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLPTM1LQ96KA5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLPTM1LQ96KA5 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLPTM1LQ96KA5 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLPTM1LQ96KA5 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLPTM1LQ96KA5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLPTM1LQ96KA5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLPTM1LQ96KA5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLPTM1LQ96KA5 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLPTM1LQ96KA5 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLPTM1LQ96KA5 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLPTM1LQ96KA5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLPTM1LQ96KA5 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLPTM1LQ96KA5 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLPTM1LQ96KA5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLPTM1LQ96KA5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLPTM1LQ96KA5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLPTM1LQ96KA5 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLPTM1LQ96KA5 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLPTM1LQ96KA5 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLPTM1LQ96KA5 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLPTM1LQ96KA5 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLPTM1LQ96KA5 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLPTM1LQ96KA5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLPTM1LQ96KA5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLPTM1LQ96KA5 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLPTM1LQ96KA5 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLPTM1LQ96KA5 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLPTM1LQ96KA5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLPTM1LQ96KA5 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLPTM1LQ96KA5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLPTM1LQ96KA5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLPTM1LQ96KA5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CLPTM1LQ96KA5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLPTM1LQ96KA5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLPTM1LQ96KA5 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLPTM1LQ96KA5 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLPTM1LQ96KA5 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLPTM1LQ96KA5 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLPTM1LQ96KA5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLPTM1LQ96KA5 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLPTM1LQ96KA5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CLPTM1LQ96KA5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLPTM1LQ96KA5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CLPTM1LQ96KA5 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLPTM1LQ96KA5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLPTM1LQ96KA5 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLPTM1LQ96KA5 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLPTM1LQ96KA5 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLPTM1LQ96KA5 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLPTM1LQ96KA5 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLPTM1LQ96KA5 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLPTM1LQ96KA5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLPTM1LQ96KA5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLPTM1LQ96KA5 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLPTM1LQ96KA5 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLPTM1LQ96KA5 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CLPTM1LQ96KA5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLPTM1LQ96KA5 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLPTM1LQ96KA5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLPTM1LQ96KA5 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLPTM1LQ96KA5 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLPTM1LQ96KA5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLPTM1LQ96KA5 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLPTM1LQ96KA5 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLPTM1LQ96KA5 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLPTM1LQ96KA5 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLPTM1LQ96KA5 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLPTM1LQ96KA5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLPTM1LQ96KA5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLPTM1LQ96KA5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLPTM1LQ96KA5 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLPTM1LQ96KA5 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLPTM1LQ96KA5 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLPTM1LQ96KA5 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLPTM1LQ96KA5 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms