Protein–RNA interactions for Protein: Q96K49

TMEM87B, Transmembrane protein 87B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM87BQ96K49 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM87BQ96K49 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM87BQ96K49 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM87BQ96K49 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM87BQ96K49 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM87BQ96K49 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM87BQ96K49 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM87BQ96K49 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM87BQ96K49 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM87BQ96K49 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM87BQ96K49 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM87BQ96K49 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM87BQ96K49 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM87BQ96K49 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM87BQ96K49 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM87BQ96K49 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM87BQ96K49 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM87BQ96K49 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM87BQ96K49 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM87BQ96K49 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM87BQ96K49 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMEM87BQ96K49 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMEM87BQ96K49 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMEM87BQ96K49 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMEM87BQ96K49 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMEM87BQ96K49 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMEM87BQ96K49 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMEM87BQ96K49 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMEM87BQ96K49 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMEM87BQ96K49 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMEM87BQ96K49 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM87BQ96K49 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM87BQ96K49 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM87BQ96K49 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM87BQ96K49 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM87BQ96K49 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM87BQ96K49 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM87BQ96K49 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM87BQ96K49 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM87BQ96K49 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM87BQ96K49 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM87BQ96K49 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM87BQ96K49 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMEM87BQ96K49 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMEM87BQ96K49 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMEM87BQ96K49 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMEM87BQ96K49 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMEM87BQ96K49 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TMEM87BQ96K49 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMEM87BQ96K49 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMEM87BQ96K49 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMEM87BQ96K49 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMEM87BQ96K49 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TMEM87BQ96K49 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
TMEM87BQ96K49 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMEM87BQ96K49 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMEM87BQ96K49 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMEM87BQ96K49 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMEM87BQ96K49 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMEM87BQ96K49 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TMEM87BQ96K49 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMEM87BQ96K49 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMEM87BQ96K49 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMEM87BQ96K49 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMEM87BQ96K49 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMEM87BQ96K49 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMEM87BQ96K49 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMEM87BQ96K49 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMEM87BQ96K49 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMEM87BQ96K49 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMEM87BQ96K49 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMEM87BQ96K49 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMEM87BQ96K49 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMEM87BQ96K49 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMEM87BQ96K49 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM87BQ96K49 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM87BQ96K49 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM87BQ96K49 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM87BQ96K49 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM87BQ96K49 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM87BQ96K49 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM87BQ96K49 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM87BQ96K49 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM87BQ96K49 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM87BQ96K49 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM87BQ96K49 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM87BQ96K49 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM87BQ96K49 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM87BQ96K49 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM87BQ96K49 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM87BQ96K49 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMEM87BQ96K49 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TMEM87BQ96K49 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMEM87BQ96K49 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMEM87BQ96K49 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMEM87BQ96K49 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMEM87BQ96K49 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMEM87BQ96K49 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMEM87BQ96K49 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMEM87BQ96K49 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms