Protein–RNA interactions for Protein: Q96HD1

CRELD1, Cysteine-rich with EGF-like domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRELD1Q96HD1 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRELD1Q96HD1 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRELD1Q96HD1 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRELD1Q96HD1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRELD1Q96HD1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRELD1Q96HD1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRELD1Q96HD1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRELD1Q96HD1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRELD1Q96HD1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRELD1Q96HD1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRELD1Q96HD1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRELD1Q96HD1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRELD1Q96HD1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRELD1Q96HD1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRELD1Q96HD1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRELD1Q96HD1 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CRELD1Q96HD1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRELD1Q96HD1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRELD1Q96HD1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRELD1Q96HD1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRELD1Q96HD1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRELD1Q96HD1 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRELD1Q96HD1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CRELD1Q96HD1 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CRELD1Q96HD1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRELD1Q96HD1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRELD1Q96HD1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRELD1Q96HD1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRELD1Q96HD1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRELD1Q96HD1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRELD1Q96HD1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRELD1Q96HD1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRELD1Q96HD1 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRELD1Q96HD1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRELD1Q96HD1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRELD1Q96HD1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRELD1Q96HD1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRELD1Q96HD1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRELD1Q96HD1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRELD1Q96HD1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRELD1Q96HD1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRELD1Q96HD1 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRELD1Q96HD1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRELD1Q96HD1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRELD1Q96HD1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRELD1Q96HD1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRELD1Q96HD1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRELD1Q96HD1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRELD1Q96HD1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRELD1Q96HD1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRELD1Q96HD1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRELD1Q96HD1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRELD1Q96HD1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRELD1Q96HD1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRELD1Q96HD1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRELD1Q96HD1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRELD1Q96HD1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRELD1Q96HD1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CRELD1Q96HD1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRELD1Q96HD1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRELD1Q96HD1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRELD1Q96HD1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRELD1Q96HD1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRELD1Q96HD1 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRELD1Q96HD1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CRELD1Q96HD1 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRELD1Q96HD1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRELD1Q96HD1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRELD1Q96HD1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRELD1Q96HD1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRELD1Q96HD1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRELD1Q96HD1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRELD1Q96HD1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRELD1Q96HD1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRELD1Q96HD1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRELD1Q96HD1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRELD1Q96HD1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRELD1Q96HD1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRELD1Q96HD1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRELD1Q96HD1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRELD1Q96HD1 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRELD1Q96HD1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRELD1Q96HD1 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CRELD1Q96HD1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CRELD1Q96HD1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CRELD1Q96HD1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CRELD1Q96HD1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CRELD1Q96HD1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CRELD1Q96HD1 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CRELD1Q96HD1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CRELD1Q96HD1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CRELD1Q96HD1 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
CRELD1Q96HD1 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CRELD1Q96HD1 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CRELD1Q96HD1 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CRELD1Q96HD1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CRELD1Q96HD1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CRELD1Q96HD1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CRELD1Q96HD1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CRELD1Q96HD1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms