Protein–RNA interactions for Protein: Q96E22

NUS1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit NUS1, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUS1Q96E22 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUS1Q96E22 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUS1Q96E22 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUS1Q96E22 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUS1Q96E22 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUS1Q96E22 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUS1Q96E22 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUS1Q96E22 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUS1Q96E22 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUS1Q96E22 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUS1Q96E22 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUS1Q96E22 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUS1Q96E22 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUS1Q96E22 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NUS1Q96E22 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUS1Q96E22 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUS1Q96E22 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NUS1Q96E22 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
NUS1Q96E22 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUS1Q96E22 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
NUS1Q96E22 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUS1Q96E22 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUS1Q96E22 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
NUS1Q96E22 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUS1Q96E22 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NUS1Q96E22 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUS1Q96E22 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUS1Q96E22 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUS1Q96E22 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUS1Q96E22 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUS1Q96E22 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUS1Q96E22 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUS1Q96E22 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUS1Q96E22 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUS1Q96E22 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUS1Q96E22 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUS1Q96E22 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUS1Q96E22 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUS1Q96E22 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUS1Q96E22 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUS1Q96E22 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUS1Q96E22 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUS1Q96E22 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUS1Q96E22 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUS1Q96E22 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUS1Q96E22 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUS1Q96E22 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUS1Q96E22 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUS1Q96E22 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUS1Q96E22 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUS1Q96E22 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUS1Q96E22 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUS1Q96E22 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUS1Q96E22 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUS1Q96E22 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUS1Q96E22 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUS1Q96E22 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUS1Q96E22 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUS1Q96E22 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUS1Q96E22 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUS1Q96E22 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUS1Q96E22 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUS1Q96E22 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUS1Q96E22 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUS1Q96E22 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUS1Q96E22 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUS1Q96E22 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUS1Q96E22 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUS1Q96E22 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUS1Q96E22 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUS1Q96E22 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUS1Q96E22 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
NUS1Q96E22 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
NUS1Q96E22 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUS1Q96E22 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUS1Q96E22 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NUS1Q96E22 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUS1Q96E22 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUS1Q96E22 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUS1Q96E22 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUS1Q96E22 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NUS1Q96E22 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUS1Q96E22 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUS1Q96E22 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUS1Q96E22 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUS1Q96E22 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUS1Q96E22 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUS1Q96E22 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUS1Q96E22 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NUS1Q96E22 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUS1Q96E22 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUS1Q96E22 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUS1Q96E22 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUS1Q96E22 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUS1Q96E22 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUS1Q96E22 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUS1Q96E22 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUS1Q96E22 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUS1Q96E22 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUS1Q96E22 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms