Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C18orf8Q96DM3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C18orf8Q96DM3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C18orf8Q96DM3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C18orf8Q96DM3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C18orf8Q96DM3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C18orf8Q96DM3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C18orf8Q96DM3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C18orf8Q96DM3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C18orf8Q96DM3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C18orf8Q96DM3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C18orf8Q96DM3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C18orf8Q96DM3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C18orf8Q96DM3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
C18orf8Q96DM3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C18orf8Q96DM3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C18orf8Q96DM3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C18orf8Q96DM3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C18orf8Q96DM3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C18orf8Q96DM3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C18orf8Q96DM3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C18orf8Q96DM3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C18orf8Q96DM3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
C18orf8Q96DM3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C18orf8Q96DM3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C18orf8Q96DM3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C18orf8Q96DM3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C18orf8Q96DM3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C18orf8Q96DM3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C18orf8Q96DM3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C18orf8Q96DM3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C18orf8Q96DM3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C18orf8Q96DM3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C18orf8Q96DM3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C18orf8Q96DM3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C18orf8Q96DM3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C18orf8Q96DM3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C18orf8Q96DM3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C18orf8Q96DM3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C18orf8Q96DM3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C18orf8Q96DM3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C18orf8Q96DM3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C18orf8Q96DM3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C18orf8Q96DM3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C18orf8Q96DM3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C18orf8Q96DM3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C18orf8Q96DM3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C18orf8Q96DM3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C18orf8Q96DM3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C18orf8Q96DM3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C18orf8Q96DM3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C18orf8Q96DM3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
C18orf8Q96DM3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C18orf8Q96DM3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C18orf8Q96DM3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C18orf8Q96DM3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C18orf8Q96DM3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C18orf8Q96DM3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C18orf8Q96DM3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
C18orf8Q96DM3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C18orf8Q96DM3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C18orf8Q96DM3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C18orf8Q96DM3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C18orf8Q96DM3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C18orf8Q96DM3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C18orf8Q96DM3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C18orf8Q96DM3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C18orf8Q96DM3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C18orf8Q96DM3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C18orf8Q96DM3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C18orf8Q96DM3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C18orf8Q96DM3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
C18orf8Q96DM3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
C18orf8Q96DM3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C18orf8Q96DM3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C18orf8Q96DM3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C18orf8Q96DM3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C18orf8Q96DM3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C18orf8Q96DM3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C18orf8Q96DM3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C18orf8Q96DM3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
C18orf8Q96DM3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
C18orf8Q96DM3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
C18orf8Q96DM3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C18orf8Q96DM3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C18orf8Q96DM3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C18orf8Q96DM3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C18orf8Q96DM3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C18orf8Q96DM3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C18orf8Q96DM3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C18orf8Q96DM3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C18orf8Q96DM3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C18orf8Q96DM3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C18orf8Q96DM3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C18orf8Q96DM3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
C18orf8Q96DM3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C18orf8Q96DM3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C18orf8Q96DM3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C18orf8Q96DM3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C18orf8Q96DM3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms