Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NMD3Q96D46 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NMD3Q96D46 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NMD3Q96D46 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NMD3Q96D46 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NMD3Q96D46 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NMD3Q96D46 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NMD3Q96D46 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NMD3Q96D46 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NMD3Q96D46 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NMD3Q96D46 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NMD3Q96D46 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NMD3Q96D46 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NMD3Q96D46 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NMD3Q96D46 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NMD3Q96D46 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NMD3Q96D46 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NMD3Q96D46 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NMD3Q96D46 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NMD3Q96D46 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NMD3Q96D46 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NMD3Q96D46 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
NMD3Q96D46 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NMD3Q96D46 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NMD3Q96D46 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NMD3Q96D46 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NMD3Q96D46 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NMD3Q96D46 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NMD3Q96D46 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NMD3Q96D46 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NMD3Q96D46 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NMD3Q96D46 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
NMD3Q96D46 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NMD3Q96D46 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NMD3Q96D46 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NMD3Q96D46 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NMD3Q96D46 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NMD3Q96D46 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NMD3Q96D46 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NMD3Q96D46 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
NMD3Q96D46 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NMD3Q96D46 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NMD3Q96D46 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NMD3Q96D46 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NMD3Q96D46 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NMD3Q96D46 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NMD3Q96D46 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NMD3Q96D46 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NMD3Q96D46 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NMD3Q96D46 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NMD3Q96D46 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NMD3Q96D46 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NMD3Q96D46 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NMD3Q96D46 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NMD3Q96D46 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NMD3Q96D46 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NMD3Q96D46 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NMD3Q96D46 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NMD3Q96D46 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NMD3Q96D46 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NMD3Q96D46 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NMD3Q96D46 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NMD3Q96D46 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NMD3Q96D46 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NMD3Q96D46 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NMD3Q96D46 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NMD3Q96D46 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NMD3Q96D46 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NMD3Q96D46 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NMD3Q96D46 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
NMD3Q96D46 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
NMD3Q96D46 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NMD3Q96D46 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NMD3Q96D46 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NMD3Q96D46 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NMD3Q96D46 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NMD3Q96D46 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NMD3Q96D46 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NMD3Q96D46 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NMD3Q96D46 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NMD3Q96D46 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NMD3Q96D46 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NMD3Q96D46 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NMD3Q96D46 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NMD3Q96D46 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NMD3Q96D46 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NMD3Q96D46 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NMD3Q96D46 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NMD3Q96D46 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NMD3Q96D46 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NMD3Q96D46 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NMD3Q96D46 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NMD3Q96D46 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NMD3Q96D46 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NMD3Q96D46 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NMD3Q96D46 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NMD3Q96D46 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NMD3Q96D46 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NMD3Q96D46 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NMD3Q96D46 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms