Protein–RNA interactions for Protein: Q96CT7

CCDC124, Coiled-coil domain-containing protein 124, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC124Q96CT7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC124Q96CT7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC124Q96CT7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC124Q96CT7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC124Q96CT7 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC124Q96CT7 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC124Q96CT7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC124Q96CT7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC124Q96CT7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC124Q96CT7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC124Q96CT7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC124Q96CT7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC124Q96CT7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC124Q96CT7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC124Q96CT7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC124Q96CT7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC124Q96CT7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC124Q96CT7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC124Q96CT7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC124Q96CT7 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC124Q96CT7 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC124Q96CT7 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC124Q96CT7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC124Q96CT7 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC124Q96CT7 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC124Q96CT7 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC124Q96CT7 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC124Q96CT7 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC124Q96CT7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC124Q96CT7 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC124Q96CT7 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC124Q96CT7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC124Q96CT7 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC124Q96CT7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC124Q96CT7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC124Q96CT7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC124Q96CT7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC124Q96CT7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC124Q96CT7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC124Q96CT7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC124Q96CT7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC124Q96CT7 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC124Q96CT7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC124Q96CT7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC124Q96CT7 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC124Q96CT7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC124Q96CT7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC124Q96CT7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC124Q96CT7 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC124Q96CT7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC124Q96CT7 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC124Q96CT7 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC124Q96CT7 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC124Q96CT7 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC124Q96CT7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC124Q96CT7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC124Q96CT7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC124Q96CT7 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC124Q96CT7 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC124Q96CT7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC124Q96CT7 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC124Q96CT7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC124Q96CT7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC124Q96CT7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC124Q96CT7 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC124Q96CT7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC124Q96CT7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC124Q96CT7 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC124Q96CT7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC124Q96CT7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC124Q96CT7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC124Q96CT7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC124Q96CT7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC124Q96CT7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC124Q96CT7 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC124Q96CT7 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC124Q96CT7 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC124Q96CT7 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC124Q96CT7 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC124Q96CT7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC124Q96CT7 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC124Q96CT7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC124Q96CT7 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC124Q96CT7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC124Q96CT7 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC124Q96CT7 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC124Q96CT7 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC124Q96CT7 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC124Q96CT7 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC124Q96CT7 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC124Q96CT7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC124Q96CT7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC124Q96CT7 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC124Q96CT7 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC124Q96CT7 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC124Q96CT7 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC124Q96CT7 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC124Q96CT7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC124Q96CT7 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC124Q96CT7 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms