Protein–RNA interactions for Protein: Q96CN9

GCC1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCC1Q96CN9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
GCC1Q96CN9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GCC1Q96CN9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
GCC1Q96CN9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
GCC1Q96CN9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
GCC1Q96CN9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
GCC1Q96CN9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
GCC1Q96CN9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GCC1Q96CN9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GCC1Q96CN9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GCC1Q96CN9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GCC1Q96CN9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GCC1Q96CN9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GCC1Q96CN9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GCC1Q96CN9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
GCC1Q96CN9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GCC1Q96CN9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GCC1Q96CN9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GCC1Q96CN9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GCC1Q96CN9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GCC1Q96CN9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GCC1Q96CN9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GCC1Q96CN9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GCC1Q96CN9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GCC1Q96CN9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GCC1Q96CN9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GCC1Q96CN9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GCC1Q96CN9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
GCC1Q96CN9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GCC1Q96CN9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GCC1Q96CN9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GCC1Q96CN9 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GCC1Q96CN9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GCC1Q96CN9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GCC1Q96CN9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GCC1Q96CN9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GCC1Q96CN9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GCC1Q96CN9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GCC1Q96CN9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
GCC1Q96CN9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GCC1Q96CN9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GCC1Q96CN9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GCC1Q96CN9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GCC1Q96CN9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GCC1Q96CN9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GCC1Q96CN9 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GCC1Q96CN9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GCC1Q96CN9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GCC1Q96CN9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GCC1Q96CN9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GCC1Q96CN9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GCC1Q96CN9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GCC1Q96CN9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GCC1Q96CN9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GCC1Q96CN9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GCC1Q96CN9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GCC1Q96CN9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
GCC1Q96CN9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GCC1Q96CN9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GCC1Q96CN9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
GCC1Q96CN9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
GCC1Q96CN9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
GCC1Q96CN9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
GCC1Q96CN9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
GCC1Q96CN9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
GCC1Q96CN9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC27.57■■■□□ 2
GCC1Q96CN9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GCC1Q96CN9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GCC1Q96CN9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GCC1Q96CN9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GCC1Q96CN9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GCC1Q96CN9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
GCC1Q96CN9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
GCC1Q96CN9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GCC1Q96CN9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.56■■■□□ 2
GCC1Q96CN9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GCC1Q96CN9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GCC1Q96CN9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
GCC1Q96CN9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GCC1Q96CN9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GCC1Q96CN9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
GCC1Q96CN9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
GCC1Q96CN9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GCC1Q96CN9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GCC1Q96CN9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
GCC1Q96CN9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GCC1Q96CN9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
GCC1Q96CN9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
GCC1Q96CN9 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
GCC1Q96CN9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
GCC1Q96CN9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.54■■■□□ 2
GCC1Q96CN9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.54■■■□□ 2
GCC1Q96CN9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GCC1Q96CN9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GCC1Q96CN9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GCC1Q96CN9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
GCC1Q96CN9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
GCC1Q96CN9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC27.53■■■□□ 2
GCC1Q96CN9 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
GCC1Q96CN9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms