Protein–RNA interactions for Protein: Q969S8

HDAC10, Histone deacetylase 10, humanhuman

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Length 669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC10Q969S8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC10Q969S8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC10Q969S8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC10Q969S8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC10Q969S8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC10Q969S8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC10Q969S8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC10Q969S8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC10Q969S8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC10Q969S8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC10Q969S8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC10Q969S8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC10Q969S8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC10Q969S8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC10Q969S8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC10Q969S8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC10Q969S8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC10Q969S8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC10Q969S8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC10Q969S8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC10Q969S8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC10Q969S8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC10Q969S8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC10Q969S8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC10Q969S8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC10Q969S8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC10Q969S8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC10Q969S8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC10Q969S8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC10Q969S8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC10Q969S8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC10Q969S8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC10Q969S8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC10Q969S8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC10Q969S8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HDAC10Q969S8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HDAC10Q969S8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC10Q969S8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC10Q969S8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC10Q969S8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC10Q969S8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC10Q969S8 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC10Q969S8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC10Q969S8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC10Q969S8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC10Q969S8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC10Q969S8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC10Q969S8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC10Q969S8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC10Q969S8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC10Q969S8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC10Q969S8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC10Q969S8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC10Q969S8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC10Q969S8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC10Q969S8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC10Q969S8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC10Q969S8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC10Q969S8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC10Q969S8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC10Q969S8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC10Q969S8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC10Q969S8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC10Q969S8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC10Q969S8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC10Q969S8 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC10Q969S8 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC10Q969S8 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC10Q969S8 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC10Q969S8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC10Q969S8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC10Q969S8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC10Q969S8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC10Q969S8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC10Q969S8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC10Q969S8 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC10Q969S8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC10Q969S8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC10Q969S8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC10Q969S8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC10Q969S8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC10Q969S8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC10Q969S8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC10Q969S8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC10Q969S8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC10Q969S8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC10Q969S8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC10Q969S8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC10Q969S8 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC10Q969S8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC10Q969S8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC10Q969S8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC10Q969S8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC10Q969S8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC10Q969S8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC10Q969S8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC10Q969S8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC10Q969S8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC10Q969S8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC10Q969S8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
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