Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF34Q969K3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF34Q969K3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF34Q969K3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF34Q969K3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF34Q969K3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF34Q969K3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF34Q969K3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF34Q969K3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF34Q969K3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF34Q969K3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF34Q969K3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF34Q969K3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF34Q969K3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF34Q969K3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF34Q969K3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF34Q969K3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF34Q969K3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF34Q969K3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF34Q969K3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF34Q969K3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF34Q969K3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF34Q969K3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF34Q969K3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF34Q969K3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF34Q969K3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF34Q969K3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF34Q969K3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF34Q969K3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF34Q969K3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF34Q969K3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF34Q969K3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF34Q969K3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF34Q969K3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF34Q969K3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF34Q969K3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF34Q969K3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF34Q969K3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF34Q969K3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF34Q969K3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF34Q969K3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RNF34Q969K3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RNF34Q969K3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RNF34Q969K3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RNF34Q969K3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RNF34Q969K3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RNF34Q969K3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RNF34Q969K3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RNF34Q969K3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RNF34Q969K3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RNF34Q969K3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RNF34Q969K3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF34Q969K3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF34Q969K3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF34Q969K3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF34Q969K3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF34Q969K3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF34Q969K3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF34Q969K3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF34Q969K3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF34Q969K3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF34Q969K3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF34Q969K3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF34Q969K3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF34Q969K3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF34Q969K3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF34Q969K3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF34Q969K3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF34Q969K3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF34Q969K3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF34Q969K3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF34Q969K3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF34Q969K3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF34Q969K3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF34Q969K3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF34Q969K3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF34Q969K3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF34Q969K3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF34Q969K3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF34Q969K3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF34Q969K3 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF34Q969K3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF34Q969K3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF34Q969K3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF34Q969K3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF34Q969K3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF34Q969K3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF34Q969K3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF34Q969K3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF34Q969K3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF34Q969K3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF34Q969K3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF34Q969K3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF34Q969K3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF34Q969K3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF34Q969K3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF34Q969K3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF34Q969K3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF34Q969K3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF34Q969K3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms