Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP13Q92995 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP13Q92995 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP13Q92995 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP13Q92995 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP13Q92995 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP13Q92995 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP13Q92995 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP13Q92995 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP13Q92995 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP13Q92995 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP13Q92995 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP13Q92995 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP13Q92995 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP13Q92995 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP13Q92995 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP13Q92995 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP13Q92995 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP13Q92995 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
USP13Q92995 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP13Q92995 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
USP13Q92995 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP13Q92995 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP13Q92995 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP13Q92995 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP13Q92995 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP13Q92995 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP13Q92995 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP13Q92995 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP13Q92995 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
USP13Q92995 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP13Q92995 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP13Q92995 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP13Q92995 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP13Q92995 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP13Q92995 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP13Q92995 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP13Q92995 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP13Q92995 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP13Q92995 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP13Q92995 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP13Q92995 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP13Q92995 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP13Q92995 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP13Q92995 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
USP13Q92995 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP13Q92995 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP13Q92995 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP13Q92995 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP13Q92995 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP13Q92995 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP13Q92995 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP13Q92995 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
USP13Q92995 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP13Q92995 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP13Q92995 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
USP13Q92995 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP13Q92995 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP13Q92995 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP13Q92995 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP13Q92995 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP13Q92995 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP13Q92995 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP13Q92995 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP13Q92995 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP13Q92995 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP13Q92995 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP13Q92995 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP13Q92995 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP13Q92995 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP13Q92995 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP13Q92995 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP13Q92995 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP13Q92995 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP13Q92995 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP13Q92995 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP13Q92995 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP13Q92995 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP13Q92995 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP13Q92995 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
USP13Q92995 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
USP13Q92995 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP13Q92995 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP13Q92995 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP13Q92995 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP13Q92995 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP13Q92995 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP13Q92995 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP13Q92995 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP13Q92995 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP13Q92995 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP13Q92995 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP13Q92995 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP13Q92995 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP13Q92995 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP13Q92995 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP13Q92995 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP13Q92995 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP13Q92995 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP13Q92995 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms