Protein–RNA interactions for Protein: Q92838

EDA, Ectodysplasin-A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDAQ92838 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EDAQ92838 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EDAQ92838 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EDAQ92838 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EDAQ92838 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EDAQ92838 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EDAQ92838 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EDAQ92838 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
EDAQ92838 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EDAQ92838 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EDAQ92838 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EDAQ92838 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
EDAQ92838 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
EDAQ92838 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EDAQ92838 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EDAQ92838 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EDAQ92838 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EDAQ92838 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EDAQ92838 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EDAQ92838 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EDAQ92838 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EDAQ92838 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EDAQ92838 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EDAQ92838 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
EDAQ92838 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
EDAQ92838 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EDAQ92838 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
EDAQ92838 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EDAQ92838 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EDAQ92838 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EDAQ92838 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
EDAQ92838 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EDAQ92838 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EDAQ92838 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EDAQ92838 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EDAQ92838 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EDAQ92838 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
EDAQ92838 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EDAQ92838 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EDAQ92838 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EDAQ92838 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EDAQ92838 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EDAQ92838 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EDAQ92838 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EDAQ92838 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EDAQ92838 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EDAQ92838 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EDAQ92838 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EDAQ92838 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EDAQ92838 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EDAQ92838 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EDAQ92838 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EDAQ92838 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EDAQ92838 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EDAQ92838 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EDAQ92838 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EDAQ92838 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EDAQ92838 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EDAQ92838 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EDAQ92838 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EDAQ92838 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EDAQ92838 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
EDAQ92838 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EDAQ92838 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EDAQ92838 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EDAQ92838 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EDAQ92838 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EDAQ92838 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EDAQ92838 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EDAQ92838 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EDAQ92838 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EDAQ92838 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EDAQ92838 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
EDAQ92838 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EDAQ92838 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EDAQ92838 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EDAQ92838 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EDAQ92838 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EDAQ92838 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EDAQ92838 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EDAQ92838 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EDAQ92838 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EDAQ92838 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EDAQ92838 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EDAQ92838 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
EDAQ92838 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EDAQ92838 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EDAQ92838 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EDAQ92838 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EDAQ92838 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EDAQ92838 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EDAQ92838 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EDAQ92838 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EDAQ92838 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EDAQ92838 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EDAQ92838 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EDAQ92838 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EDAQ92838 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EDAQ92838 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EDAQ92838 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 311.5 ms