Protein–RNA interactions for Protein: Q92604

LPGAT1, Acyl-CoA:lysophosphatidylglycerol acyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPGAT1Q92604 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LPGAT1Q92604 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LPGAT1Q92604 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LPGAT1Q92604 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LPGAT1Q92604 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LPGAT1Q92604 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LPGAT1Q92604 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LPGAT1Q92604 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LPGAT1Q92604 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LPGAT1Q92604 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LPGAT1Q92604 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LPGAT1Q92604 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LPGAT1Q92604 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
LPGAT1Q92604 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LPGAT1Q92604 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LPGAT1Q92604 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
LPGAT1Q92604 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
LPGAT1Q92604 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LPGAT1Q92604 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LPGAT1Q92604 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LPGAT1Q92604 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LPGAT1Q92604 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LPGAT1Q92604 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LPGAT1Q92604 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LPGAT1Q92604 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LPGAT1Q92604 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LPGAT1Q92604 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LPGAT1Q92604 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LPGAT1Q92604 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LPGAT1Q92604 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LPGAT1Q92604 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LPGAT1Q92604 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LPGAT1Q92604 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LPGAT1Q92604 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LPGAT1Q92604 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LPGAT1Q92604 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LPGAT1Q92604 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LPGAT1Q92604 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LPGAT1Q92604 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LPGAT1Q92604 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LPGAT1Q92604 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LPGAT1Q92604 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LPGAT1Q92604 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LPGAT1Q92604 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LPGAT1Q92604 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LPGAT1Q92604 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LPGAT1Q92604 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LPGAT1Q92604 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LPGAT1Q92604 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LPGAT1Q92604 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LPGAT1Q92604 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LPGAT1Q92604 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LPGAT1Q92604 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LPGAT1Q92604 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LPGAT1Q92604 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LPGAT1Q92604 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LPGAT1Q92604 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LPGAT1Q92604 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LPGAT1Q92604 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LPGAT1Q92604 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LPGAT1Q92604 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LPGAT1Q92604 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LPGAT1Q92604 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LPGAT1Q92604 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LPGAT1Q92604 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LPGAT1Q92604 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LPGAT1Q92604 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LPGAT1Q92604 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LPGAT1Q92604 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LPGAT1Q92604 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LPGAT1Q92604 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LPGAT1Q92604 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LPGAT1Q92604 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LPGAT1Q92604 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LPGAT1Q92604 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LPGAT1Q92604 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LPGAT1Q92604 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LPGAT1Q92604 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LPGAT1Q92604 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LPGAT1Q92604 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LPGAT1Q92604 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LPGAT1Q92604 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LPGAT1Q92604 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LPGAT1Q92604 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LPGAT1Q92604 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LPGAT1Q92604 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LPGAT1Q92604 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LPGAT1Q92604 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LPGAT1Q92604 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LPGAT1Q92604 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LPGAT1Q92604 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LPGAT1Q92604 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LPGAT1Q92604 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LPGAT1Q92604 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LPGAT1Q92604 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LPGAT1Q92604 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LPGAT1Q92604 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LPGAT1Q92604 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LPGAT1Q92604 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LPGAT1Q92604 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms